79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1382 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  47.89 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  38.7 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  41.08 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  29.17 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  28.47 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  28.11 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  28.15 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  28.57 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  23.59 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  25.23 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  24.82 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  29.71 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  25.53 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  27.89 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  33.1 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.97 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.34 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  25 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  27.66 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  30.94 
 
 		 334 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  30.52 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  30.52 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  30.52 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  25.97 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.91 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.65 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  31.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  31.54 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  31.54 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  31.97 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  31.54 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  28.36 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.01 
 
 		 321 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  29.29 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  31.97 
 
 		 304 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  29.1 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  27.01 
 
 		 292 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 304 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.38 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37371  predicted protein  26.14 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  32.45 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26403  predicted protein  29.45 
 
 		 621 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00293247  decreased coverage  0.00469523 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  30.77 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  30.5 
 
 		 326 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  24.62 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  32.62 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  29.1 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  27.08 
 
 		 344 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  25.9 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.94 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  29.66 
 
 		 328 aa  45.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  24.48 
 
 		 330 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  24.48 
 
 		 330 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  27.81 
 
 		 282 aa  45.1  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  25.34 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  26.75 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  25.87 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30.56 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  24.65 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  27.08 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  21.09 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  27.7 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  27.4 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  26.17 
 
 		 400 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  27.4 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  29.88 
 
 		 304 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 526 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  22.38 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  30.82 
 
 		 288 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  26.71 
 
 		 287 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  26.67 
 
 		 282 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  25.42 
 
 		 322 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  22.97 
 
 		 305 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>