25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2297 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
344 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  84.01 
 
 
344 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  53.75 
 
 
334 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  42.9 
 
 
332 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  39.42 
 
 
326 aa  242  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  27.36 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  27.51 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  25.77 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  28.08 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  32.33 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  29.22 
 
 
271 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  28.09 
 
 
262 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  26.04 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  28.49 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  30.47 
 
 
282 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  26 
 
 
236 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  25.61 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  27.94 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  26.21 
 
 
253 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  40.48 
 
 
257 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  30.84 
 
 
230 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  43.4 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  25.27 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>