48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_18900 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  100 
 
 
283 aa  584  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  32.35 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  33.88 
 
 
236 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  24.51 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  25.77 
 
 
352 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  26.37 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  24.31 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  25.32 
 
 
196 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  28.12 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  30.61 
 
 
334 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  27.27 
 
 
185 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  28.06 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  26.04 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.89 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  24.11 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  25.43 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  28.1 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.68 
 
 
376 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  26.36 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  27.34 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  24.66 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  25.93 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  23.47 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  25.93 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.15 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  25.74 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  25.6 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.15 
 
 
401 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.15 
 
 
401 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  25.37 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26.32 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.43 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  24.29 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  26.39 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.85 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  26 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  28.47 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  22.97 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  23.7 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  24.22 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  24.29 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  24.29 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  26.39 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  25 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  23.38 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  22.73 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>