63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47593 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  100 
 
 
663 aa  1393    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26403  predicted protein  27.59 
 
 
621 aa  146  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00293247  decreased coverage  0.00469523 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.01 
 
 
385 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  32.89 
 
 
269 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  32.03 
 
 
369 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  25.46 
 
 
281 aa  53.9  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  27.22 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  32.19 
 
 
298 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.82 
 
 
380 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.4 
 
 
401 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.4 
 
 
401 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  30.37 
 
 
253 aa  51.2  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  32.37 
 
 
352 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  30.2 
 
 
305 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  29.33 
 
 
267 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  26.9 
 
 
273 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  29.38 
 
 
314 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  29.45 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  32.62 
 
 
304 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  24.86 
 
 
272 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.37 
 
 
304 aa  48.5  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 
272 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  25.96 
 
 
267 aa  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  30.08 
 
 
271 aa  48.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  26.04 
 
 
407 aa  47.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  27.42 
 
 
407 aa  47.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  31.65 
 
 
218 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  31.65 
 
 
218 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  27.33 
 
 
270 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.34 
 
 
303 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 
304 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  31.29 
 
 
305 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.91 
 
 
304 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  28.74 
 
 
431 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  31.1 
 
 
626 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  24.58 
 
 
265 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  32.65 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  31.91 
 
 
304 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  29.73 
 
 
304 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  31.29 
 
 
305 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  31.29 
 
 
305 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  30.41 
 
 
319 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  37.5 
 
 
292 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  31.91 
 
 
304 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  27.33 
 
 
323 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  27.43 
 
 
411 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  30.18 
 
 
259 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  47.92 
 
 
287 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  31.55 
 
 
597 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  29.49 
 
 
287 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 
304 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  29.55 
 
 
262 aa  45.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  31.33 
 
 
285 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  24.07 
 
 
283 aa  44.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  27.92 
 
 
314 aa  44.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  33.56 
 
 
597 aa  44.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  30.66 
 
 
287 aa  44.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.68 
 
 
256 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  26.05 
 
 
248 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  27.81 
 
 
287 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.66 
 
 
287 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  30.87 
 
 
312 aa  43.9  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32.12 
 
 
287 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>