174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1191 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  100 
 
 		 367 aa  723    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  85.01 
 
 		 367 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  62.06 
 
 		 367 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  61.96 
 
 		 367 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  62.33 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  61.79 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  60.6 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  40.99 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  44.77 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  41.25 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  42.6 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  38.05 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.08 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  41.26 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  39.94 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  38.42 
 
 		 495 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  39.85 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  37.57 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.67 
 
 		 420 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1069  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  37.31 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0920  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.84 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.0740975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.2 
 
 		 516 aa  179  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.83 
 
 		 523 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  36.47 
 
 		 552 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0897  tetratricopeptide TPR_2  36.44 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.380164  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  30.25 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  31.34 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2685  putative cytochrome c-type biogenesis protein, cycH  31.73 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0968  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  28.33 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1343  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  30.96 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  0.0463819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1878  cytochrome c biogenesis factor-like protein  30.48 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0511  putative cytochrome c-type biogenesis protein, CycH  29.52 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  28.81 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 494 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0591  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3893  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.58 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0160389  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1878  cytochrome c biogenesis factor-like  26.24 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  25.09 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0430  putative cytochrome c-type biogenesis protein CycH  27.17 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2772  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1393  tetratricopeptide TPR_4  30.95 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1690  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0640145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  28.95 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4773  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2855  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.43 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  31.84 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  24.5 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  32.64 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.97 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1552  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.35552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.97 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  24.31 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  32.03 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  28.82 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1620  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2929  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.46 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1414  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47005  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1568  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1625  truncated C-type cytochrome biogenesis protein  33.6 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  28.92 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0940  cytochrome c biogenesis factor  26.01 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0687365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00857  C-type cytochrome biogenesis protein  30.16 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  22.74 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06070  C-type cytochrome biogenesis protein  30.16 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000967954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  26.85 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3285  cytochrome c biogenesis factor  26.29 
 
 		 216 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2426  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  28.46 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3385  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  24.56 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 739 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.25 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 4079 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 		 626 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2729  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  30.08 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1513  cytochrome c biogenesis factor  27.22 
 
 		 224 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3993  cytochrome c biogenesis factor-like protein  34.07 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.09 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 627 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0181  TPR repeat-containing protein  19.7 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2857  cytochrome c biogenesis factor-like protein  33.18 
 
 		 258 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 235 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  21.43 
 
 		 415 aa  49.7  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2652  cytochrome c biogenesis factor  36.76 
 
 		 216 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4541  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  26.61 
 
 		 206 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.942267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4627  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG  26.61 
 
 		 206 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>