More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4441 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  77.54 
 
 
325 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1856  heat shock protein DnaJ domain protein  41.06 
 
 
362 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.97 
 
 
256 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  48.61 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  36.47 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  45.33 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  36.59 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  47.22 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  36.59 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  46.58 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.11 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  45.71 
 
 
519 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  47.22 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  41.25 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.11 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  41.25 
 
 
377 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  45.83 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.45 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  44.44 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
380 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
187 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  38.75 
 
 
376 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  38.75 
 
 
376 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
382 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.08 
 
 
287 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  38.96 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  41.67 
 
 
645 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  40 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  37.35 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  43.06 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1280  DnaJ domain protein  41.1 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2348  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
380 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
190 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
373 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
378 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
378 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3476  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.1 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00429307  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
376 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  39.24 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
388 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  42.65 
 
 
378 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
362 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  40.79 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
388 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.56 
 
 
324 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  38.96 
 
 
374 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.08 
 
 
289 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  35.96 
 
 
330 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  38.96 
 
 
374 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
381 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  36.25 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  35.8 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.35 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.36 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  41.56 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  36.25 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  41.67 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0830  heat shock protein DnaJ-like  42.31 
 
 
365 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  40.48 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  38.75 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
190 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  37.35 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  41.33 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.75 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.67 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  38.03 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  40.24 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  38.89 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1525  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  46.38 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
381 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  30.12 
 
 
276 aa  54.3  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>