More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2495 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
373 aa  765    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  59.53 
 
 
374 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  63.83 
 
 
374 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  60.68 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  54.78 
 
 
380 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  56.28 
 
 
382 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  56.66 
 
 
379 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  57.11 
 
 
379 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  56.14 
 
 
386 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  58.71 
 
 
377 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  53.64 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
381 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  53.33 
 
 
366 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  55.01 
 
 
386 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  53.97 
 
 
377 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  56.67 
 
 
376 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  54.23 
 
 
371 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  54.23 
 
 
371 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  54.23 
 
 
371 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  54.23 
 
 
371 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
371 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
371 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
371 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  54.13 
 
 
368 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
371 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
371 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  50.54 
 
 
373 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 
370 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  52.25 
 
 
387 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  52.52 
 
 
387 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  52.52 
 
 
371 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  51.99 
 
 
374 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
380 aa  363  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  56.15 
 
 
372 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
386 aa  362  4e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  54.67 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 
377 aa  361  9e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
373 aa  361  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  54.4 
 
 
374 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
374 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  55.11 
 
 
376 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  54.83 
 
 
376 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  54.83 
 
 
376 aa  358  9e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  54.81 
 
 
372 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  54.83 
 
 
376 aa  358  9e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  54.83 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  54.83 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  54.83 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  54.83 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  47.04 
 
 
376 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 
376 aa  355  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  50.8 
 
 
370 aa  355  6.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
396 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  50.9 
 
 
380 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  48.83 
 
 
379 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  48.83 
 
 
379 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  51.3 
 
 
379 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  55.76 
 
 
373 aa  352  5e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  53.67 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  53.67 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  53.67 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  53.67 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  53.67 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  52.17 
 
 
365 aa  351  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  50.66 
 
 
374 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  49.87 
 
 
381 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 
388 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
380 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  51.04 
 
 
378 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  52.41 
 
 
379 aa  349  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  52.41 
 
 
379 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
375 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  52.41 
 
 
379 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  52.69 
 
 
378 aa  348  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
378 aa  348  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
388 aa  348  8e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
382 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
379 aa  347  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  53.98 
 
 
377 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
373 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
373 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  53.69 
 
 
377 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  50.69 
 
 
377 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
382 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
378 aa  345  7e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  53.5 
 
 
382 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  50.66 
 
 
375 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  51.42 
 
 
376 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  47.14 
 
 
383 aa  343  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  51.48 
 
 
381 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  51.59 
 
 
376 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  47.75 
 
 
377 aa  342  5e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  52.56 
 
 
381 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
376 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  46.91 
 
 
388 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  50.91 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
378 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  51.06 
 
 
375 aa  339  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
378 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
378 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>