More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0830 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0830  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
365 aa  735    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 
386 aa  296  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
375 aa  258  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  40.56 
 
 
374 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  40.87 
 
 
381 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  39.73 
 
 
388 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  40.92 
 
 
396 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  39.06 
 
 
379 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  37.77 
 
 
385 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  38.57 
 
 
379 aa  248  8e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
388 aa  249  8e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 
376 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
374 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  38.95 
 
 
370 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
374 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  40.34 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  39.66 
 
 
375 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  37.23 
 
 
361 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  40.06 
 
 
371 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  37.81 
 
 
388 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  36.74 
 
 
374 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  40.72 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  39.23 
 
 
370 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  39.68 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  38.11 
 
 
381 aa  239  8e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  37.4 
 
 
373 aa  238  9e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  39.78 
 
 
379 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  40.28 
 
 
376 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  38.4 
 
 
394 aa  237  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  41.44 
 
 
369 aa  236  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
384 aa  236  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  41.16 
 
 
369 aa  235  9e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  38.59 
 
 
375 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  39.62 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  37.12 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  36.39 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  38.15 
 
 
388 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  38.8 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  36.41 
 
 
379 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  36.41 
 
 
379 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
378 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
378 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
378 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
356 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  39 
 
 
378 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
378 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
378 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
378 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  39.83 
 
 
375 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  40.06 
 
 
376 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  38.61 
 
 
375 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  38.95 
 
 
355 aa  230  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
372 aa  229  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  40.4 
 
 
361 aa  229  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  39.01 
 
 
381 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
376 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  39.12 
 
 
374 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  37.85 
 
 
379 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  38.66 
 
 
371 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 
380 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  38.61 
 
 
382 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
376 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  39.18 
 
 
369 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  38.25 
 
 
387 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  39.19 
 
 
375 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  35.11 
 
 
386 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
376 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  36.83 
 
 
389 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  39.18 
 
 
374 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  36.56 
 
 
395 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
376 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
376 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  37.85 
 
 
379 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
380 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  37.85 
 
 
379 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  37.85 
 
 
379 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  37.47 
 
 
377 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  38.4 
 
 
380 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
379 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 
375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  38.29 
 
 
379 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  38.29 
 
 
379 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  38.29 
 
 
379 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  38.29 
 
 
379 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  38.29 
 
 
379 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  37.4 
 
 
382 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
377 aa  226  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  38.86 
 
 
377 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  37.98 
 
 
387 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
375 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
359 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  37.39 
 
 
377 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  38.61 
 
 
378 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  37.88 
 
 
382 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>