More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0248 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
375 aa  760    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  73.74 
 
 
376 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  72.34 
 
 
374 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  63.86 
 
 
369 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  65.77 
 
 
367 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  66.39 
 
 
369 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  53.72 
 
 
374 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  51.55 
 
 
377 aa  363  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
380 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  51.23 
 
 
365 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  51.6 
 
 
382 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  52.86 
 
 
374 aa  355  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  50.8 
 
 
382 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  50.8 
 
 
382 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  53.28 
 
 
378 aa  352  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  48.94 
 
 
379 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  50.96 
 
 
376 aa  349  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  51.42 
 
 
376 aa  348  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
373 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  50.42 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  50.42 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
378 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  52.14 
 
 
376 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  47.14 
 
 
384 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  49.44 
 
 
376 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  49.44 
 
 
376 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  49.44 
 
 
376 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 
372 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  49.44 
 
 
376 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  51.99 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  49.44 
 
 
376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  49.44 
 
 
376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  50.28 
 
 
377 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  51.32 
 
 
382 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  50.57 
 
 
379 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  49.44 
 
 
376 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  50.57 
 
 
379 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  50.57 
 
 
379 aa  342  5e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  49.72 
 
 
379 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  49.58 
 
 
380 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  49.29 
 
 
376 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
377 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
377 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
375 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
377 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  50.71 
 
 
378 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  47.3 
 
 
375 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  47.88 
 
 
375 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  51.14 
 
 
377 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  50.86 
 
 
376 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
378 aa  338  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  48.56 
 
 
385 aa  337  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  49.72 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  51.14 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  49.57 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  51.14 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  51.14 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  47.11 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  46.84 
 
 
382 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
375 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
374 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  51.09 
 
 
372 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  48.43 
 
 
376 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
374 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
375 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  51.14 
 
 
374 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  48.43 
 
 
376 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
383 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  49.57 
 
 
377 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
375 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  49.57 
 
 
374 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
376 aa  333  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  52.97 
 
 
381 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
376 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
376 aa  333  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  47.03 
 
 
374 aa  333  4e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  47.45 
 
 
385 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
376 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  49.43 
 
 
376 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  48.71 
 
 
373 aa  332  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  48.54 
 
 
374 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  49.14 
 
 
376 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  48.72 
 
 
379 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  48.72 
 
 
379 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  49.14 
 
 
376 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  48.72 
 
 
379 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  48.72 
 
 
379 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
379 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
373 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  48.72 
 
 
379 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  48.45 
 
 
379 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  48.45 
 
 
379 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  48.54 
 
 
371 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  48.54 
 
 
374 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>