More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1492 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
365 aa  743    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  53.33 
 
 
384 aa  381  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  52.75 
 
 
374 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  50.29 
 
 
377 aa  361  9e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  52.86 
 
 
376 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  52.19 
 
 
369 aa  359  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  51.91 
 
 
375 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  54.52 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  50.27 
 
 
374 aa  352  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  51.16 
 
 
377 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
376 aa  348  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  52.39 
 
 
377 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  50.72 
 
 
375 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  51.9 
 
 
373 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  51.99 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  50.7 
 
 
375 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  50.41 
 
 
374 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  51.69 
 
 
382 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  52.54 
 
 
377 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  48.28 
 
 
386 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  49.07 
 
 
381 aa  338  7e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  50.56 
 
 
397 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  49.71 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  49.86 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  50.99 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  50.7 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  50.14 
 
 
376 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  47.56 
 
 
371 aa  335  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  50.14 
 
 
376 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  335  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  51.03 
 
 
367 aa  335  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  50.42 
 
 
374 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  49.59 
 
 
374 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
375 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  49.59 
 
 
374 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  49.15 
 
 
379 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  49.15 
 
 
379 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  49.15 
 
 
379 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  49.71 
 
 
376 aa  333  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  49.15 
 
 
379 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  49.15 
 
 
379 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  49 
 
 
376 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
378 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
378 aa  332  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
378 aa  332  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  49.58 
 
 
378 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  48.3 
 
 
378 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  48.3 
 
 
378 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  48.3 
 
 
378 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  48.7 
 
 
379 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  45.41 
 
 
380 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  48.35 
 
 
372 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  48.7 
 
 
379 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
370 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  48.7 
 
 
379 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  49.17 
 
 
380 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  48.57 
 
 
376 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
372 aa  329  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  49.42 
 
 
377 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  47.59 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  46.99 
 
 
375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  48.3 
 
 
378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  48.3 
 
 
378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 
372 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  47.73 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  48.42 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  48.09 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  48.34 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  47.97 
 
 
389 aa  326  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
370 aa  326  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  47.81 
 
 
387 aa  326  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  46.89 
 
 
373 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  45.26 
 
 
378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 
372 aa  325  6e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  48.99 
 
 
374 aa  325  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
376 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
376 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
377 aa  325  9e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
372 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  47.18 
 
 
380 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  48.43 
 
 
382 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  46.44 
 
 
377 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  47.71 
 
 
376 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  47.01 
 
 
379 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  47.71 
 
 
376 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  47.03 
 
 
379 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  47.71 
 
 
376 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  47.71 
 
 
376 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  47.96 
 
 
378 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  47.01 
 
 
379 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  47.71 
 
 
376 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>