More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4727 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  98.4 
 
 		 375 aa  709    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  89.47 
 
 		 380 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  88.16 
 
 		 380 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  99.73 
 
 		 374 aa  757    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  91.44 
 
 		 397 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  98.93 
 
 		 374 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  100 
 
 		 374 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  84.8 
 
 		 375 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  86.4 
 
 		 375 aa  625  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  82.49 
 
 		 377 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  81.96 
 
 		 377 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  71.81 
 
 		 389 aa  524  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  71.47 
 
 		 376 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  71.47 
 
 		 377 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2732  chaperone protein DnaJ  74.06 
 
 		 374 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000152871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  67.28 
 
 		 379 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  67.28 
 
 		 379 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  67.28 
 
 		 379 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  67.46 
 
 		 377 aa  511  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  69.87 
 
 		 377 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  69.87 
 
 		 377 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 376 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  67.28 
 
 		 378 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  70.13 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  68.88 
 
 		 378 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  67.99 
 
 		 377 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  69.87 
 
 		 377 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  67.02 
 
 		 378 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  66.76 
 
 		 376 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  68.97 
 
 		 378 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  69.87 
 
 		 377 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  68.97 
 
 		 378 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  69.87 
 
 		 377 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  69.87 
 
 		 377 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  70.13 
 
 		 376 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  66.23 
 
 		 379 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  66.23 
 
 		 379 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  66.23 
 
 		 379 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  67.55 
 
 		 381 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  70.21 
 
 		 374 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  68.52 
 
 		 379 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  66.23 
 
 		 379 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  66.23 
 
 		 379 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  69.6 
 
 		 377 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  67.11 
 
 		 375 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  70.93 
 
 		 376 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  65.52 
 
 		 379 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  65.52 
 
 		 379 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3963  chaperone protein DnaJ  68.45 
 
 		 374 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  68.09 
 
 		 376 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  63.87 
 
 		 382 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  63.1 
 
 		 377 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  68.7 
 
 		 377 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  65.96 
 
 		 381 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  66.14 
 
 		 380 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  65.61 
 
 		 380 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  62.2 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  65.86 
 
 		 372 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  64.25 
 
 		 373 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  66.76 
 
 		 381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  66.32 
 
 		 382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  61.93 
 
 		 375 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  60.37 
 
 		 372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  67.54 
 
 		 383 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  61.39 
 
 		 374 aa  461  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  66.49 
 
 		 381 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  65.26 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  67.02 
 
 		 377 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  63.83 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  59.06 
 
 		 380 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  60.27 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  58.47 
 
 		 380 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  59.37 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  59.42 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  58.95 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  59.47 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  59.2 
 
 		 373 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  58.84 
 
 		 379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  58.99 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  59.26 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  59.26 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  58.99 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  59.26 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  59.2 
 
 		 376 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  59.2 
 
 		 376 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  59.2 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  58.73 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  59.47 
 
 		 376 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  60.53 
 
 		 376 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  58.93 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  58.2 
 
 		 379 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  60.27 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  58.93 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>