More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2162 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
367 aa  749    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  68.38 
 
 
374 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  68.55 
 
 
376 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  66.04 
 
 
375 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  60.49 
 
 
369 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  57.38 
 
 
369 aa  408  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  50.87 
 
 
377 aa  340  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
384 aa  339  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  49.3 
 
 
365 aa  338  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  51.18 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  49.03 
 
 
376 aa  332  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
375 aa  332  9e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  51.28 
 
 
374 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  46.24 
 
 
380 aa  329  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  49.42 
 
 
375 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  51.88 
 
 
372 aa  325  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  45.55 
 
 
379 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
378 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
378 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
378 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
378 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  48.24 
 
 
377 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  49.42 
 
 
376 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
378 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  47.8 
 
 
378 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
378 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 
379 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
374 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  50.43 
 
 
374 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  48.01 
 
 
380 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
375 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  50.86 
 
 
377 aa  322  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  47.85 
 
 
377 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  48.91 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  47.73 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  49.85 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  48.91 
 
 
371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  50.15 
 
 
374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  50.15 
 
 
374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  49.56 
 
 
375 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
382 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  50.15 
 
 
374 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  48.46 
 
 
374 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
377 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  51.03 
 
 
374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  49.43 
 
 
382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
379 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  51.74 
 
 
376 aa  319  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
373 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  49.27 
 
 
378 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  48.55 
 
 
376 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  48.55 
 
 
376 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
376 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  48.6 
 
 
382 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
376 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  48.6 
 
 
382 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  49.71 
 
 
377 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  49.71 
 
 
377 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
376 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
376 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  47.41 
 
 
376 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
376 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  49.71 
 
 
377 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  45.72 
 
 
382 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  50.29 
 
 
377 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  50.29 
 
 
377 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
376 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
376 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  49.01 
 
 
379 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  49.57 
 
 
378 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  49.01 
 
 
379 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  49.01 
 
 
379 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
377 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
379 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
379 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
379 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
379 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
379 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  48.7 
 
 
378 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
380 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  48.41 
 
 
378 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  49.3 
 
 
374 aa  315  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  45.66 
 
 
375 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  47.81 
 
 
375 aa  315  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2925  chaperone protein DnaJ  51.91 
 
 
377 aa  315  8e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  46.86 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  46.86 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  45.92 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  49.03 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>