More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2004 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  99.48 
 
 
387 aa  782    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
387 aa  785    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  54.45 
 
 
386 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  53.4 
 
 
379 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  53.65 
 
 
382 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  52.49 
 
 
375 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  52.32 
 
 
388 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  52.21 
 
 
373 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
374 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
381 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  52.82 
 
 
388 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  52.73 
 
 
382 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  52.11 
 
 
376 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  49.61 
 
 
380 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  48.83 
 
 
373 aa  362  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  48.83 
 
 
386 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  53.37 
 
 
380 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  51.81 
 
 
377 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  45.06 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  53.21 
 
 
383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  49.74 
 
 
376 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  49.74 
 
 
376 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  52.08 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
376 aa  355  7.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
376 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
376 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
376 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
376 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
376 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  47.66 
 
 
370 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
379 aa  354  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 
376 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  49.49 
 
 
388 aa  351  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  48.18 
 
 
374 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  53.39 
 
 
374 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  51.16 
 
 
366 aa  349  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
375 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  48.19 
 
 
378 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  51.74 
 
 
373 aa  347  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  48.19 
 
 
378 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  51.17 
 
 
377 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  47.45 
 
 
386 aa  346  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 
370 aa  346  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  49.06 
 
 
379 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  49.06 
 
 
379 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  50.27 
 
 
377 aa  346  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
376 aa  346  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  49.06 
 
 
379 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  46.51 
 
 
375 aa  345  6e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  48.19 
 
 
382 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
372 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
374 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  52.56 
 
 
379 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 
377 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  52.56 
 
 
379 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  49.87 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  48.31 
 
 
375 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  47.55 
 
 
388 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 
377 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  46.75 
 
 
379 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
374 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  47.93 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
379 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
379 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  48.45 
 
 
378 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 
374 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
396 aa  338  7e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  48.19 
 
 
375 aa  338  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  46.89 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  48.86 
 
 
388 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  49.05 
 
 
377 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  50.91 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  48.16 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  48.79 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  47.41 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  47.67 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  52.21 
 
 
381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  47.53 
 
 
381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  48.31 
 
 
374 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  49.09 
 
 
373 aa  336  5e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  48.31 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  48.05 
 
 
374 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  47.27 
 
 
376 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  47.67 
 
 
356 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
380 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  48.83 
 
 
378 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
384 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
379 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  46.23 
 
 
382 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 
381 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  46.48 
 
 
375 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  47.66 
 
 
378 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  46.91 
 
 
385 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>