More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1147 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
373 aa  759    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  84.21 
 
 
379 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  84.21 
 
 
379 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  61.52 
 
 
380 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  57.07 
 
 
382 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  58.71 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  56.18 
 
 
377 aa  401  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  55.35 
 
 
379 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  54.22 
 
 
379 aa  386  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  56.57 
 
 
368 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  56.65 
 
 
371 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  56.38 
 
 
371 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  56.38 
 
 
371 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  56.38 
 
 
371 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  56.65 
 
 
371 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  56.38 
 
 
371 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  56.38 
 
 
371 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  56.38 
 
 
371 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  56.38 
 
 
371 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  51.54 
 
 
388 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
379 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  51.71 
 
 
383 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  51.49 
 
 
375 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  49.08 
 
 
374 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
373 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
379 aa  348  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
376 aa  347  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.54 
 
 
377 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
373 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  47.66 
 
 
382 aa  339  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
387 aa  338  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  43.93 
 
 
381 aa  338  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  47.77 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  47.26 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  47.77 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  47.77 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  47.77 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  47.26 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  47.26 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  47.26 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  47.26 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  47 
 
 
378 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 
386 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  49.34 
 
 
374 aa  335  7e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
377 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
376 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
376 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  46.72 
 
 
377 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
376 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  47.35 
 
 
375 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
376 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  47.4 
 
 
381 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  47.24 
 
 
376 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
372 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
374 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
373 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  46.74 
 
 
379 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  46.13 
 
 
386 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  50.84 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  48.95 
 
 
380 aa  329  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  46.61 
 
 
380 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  47 
 
 
380 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  47.55 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  47.63 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  47.61 
 
 
375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  46.74 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
379 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  47.25 
 
 
356 aa  325  6e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  46.84 
 
 
376 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
373 aa  325  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
375 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  45.43 
 
 
380 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  45.81 
 
 
381 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1165  chaperone protein DnaJ  47.17 
 
 
372 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
385 aa  322  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
376 aa  322  6e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  47.49 
 
 
376 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
376 aa  322  8e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  47.49 
 
 
376 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  48.03 
 
 
378 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
376 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
376 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
376 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  46.96 
 
 
356 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
376 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  48.73 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
378 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
375 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  47.64 
 
 
379 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  47.64 
 
 
379 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  46.95 
 
 
373 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  47.64 
 
 
379 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>