More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4393 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  94.59 
 
 
370 aa  720    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
370 aa  750    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  72.78 
 
 
373 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  58.29 
 
 
378 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  55.2 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
386 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  53.3 
 
 
382 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
382 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  51.44 
 
 
386 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  51.73 
 
 
374 aa  364  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  48.97 
 
 
379 aa  359  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
373 aa  358  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  47.91 
 
 
380 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  50.54 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  48.72 
 
 
356 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  45.57 
 
 
388 aa  349  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  50.28 
 
 
376 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  48.43 
 
 
356 aa  346  4e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 
381 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
388 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
379 aa  343  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  49.2 
 
 
377 aa  342  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 
359 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
377 aa  343  4e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  48.68 
 
 
380 aa  339  5e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  46.25 
 
 
377 aa  335  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  46.25 
 
 
386 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  332  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  332  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 
379 aa  332  6e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  45.04 
 
 
379 aa  331  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
384 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  44.86 
 
 
375 aa  328  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  46.51 
 
 
375 aa  327  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  47.84 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  47.04 
 
 
375 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  45.84 
 
 
376 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  45.84 
 
 
376 aa  325  7e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  46.38 
 
 
374 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.54 
 
 
377 aa  325  9e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  49.86 
 
 
378 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  45.84 
 
 
376 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  45.84 
 
 
376 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
374 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  45.84 
 
 
376 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  45.84 
 
 
376 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  45.84 
 
 
376 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  46.24 
 
 
377 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.58 
 
 
376 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  46.34 
 
 
375 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  45.58 
 
 
376 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  43.3 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  46.92 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  45.14 
 
 
374 aa  320  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  44.15 
 
 
379 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  44.15 
 
 
379 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
372 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  44.15 
 
 
379 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  44.15 
 
 
379 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  44.15 
 
 
379 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
387 aa  319  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  45.97 
 
 
374 aa  318  7e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  45.87 
 
 
374 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
382 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  46.51 
 
 
374 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
374 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  46.51 
 
 
374 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
382 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
382 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  45.14 
 
 
380 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
385 aa  316  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  44.27 
 
 
377 aa  315  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
377 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  50.42 
 
 
373 aa  315  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  45.65 
 
 
373 aa  315  8e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  45.43 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  46.33 
 
 
379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  45.35 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  46.33 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  46.96 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  45.65 
 
 
375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
374 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.5 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.5 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.5 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  45.07 
 
 
397 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
377 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>