More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1577 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  100 
 
 
377 aa  762    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
373 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  53.14 
 
 
379 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  52.58 
 
 
386 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  50.93 
 
 
374 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  53.81 
 
 
382 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  50.66 
 
 
375 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  47.79 
 
 
381 aa  354  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
379 aa  352  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
374 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  48.03 
 
 
370 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  49.34 
 
 
373 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  49.61 
 
 
386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  48.3 
 
 
380 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  48.45 
 
 
388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
370 aa  336  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  50.7 
 
 
380 aa  335  7.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  45.29 
 
 
376 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  47.77 
 
 
382 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  47.75 
 
 
376 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  46.83 
 
 
384 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  46.72 
 
 
384 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
356 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  49.07 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  46.84 
 
 
374 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  44.5 
 
 
382 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  44.5 
 
 
382 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  47.88 
 
 
356 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  47.33 
 
 
388 aa  322  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  47.41 
 
 
380 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  47.07 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  45.84 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  48.5 
 
 
387 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  46.28 
 
 
359 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  48.23 
 
 
387 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  46.81 
 
 
376 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
382 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
385 aa  316  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  46.68 
 
 
376 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  46.68 
 
 
376 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  46.68 
 
 
376 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  46.68 
 
 
376 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  46.74 
 
 
378 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  45.73 
 
 
377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  49.34 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  45.43 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  44.86 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  46.83 
 
 
378 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  46.83 
 
 
378 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  46.83 
 
 
378 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  46.42 
 
 
376 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  46.42 
 
 
376 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  50.27 
 
 
373 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  46.83 
 
 
378 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  46.63 
 
 
379 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  47.27 
 
 
379 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
383 aa  311  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  46.63 
 
 
379 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  46.42 
 
 
376 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  47.09 
 
 
378 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  47.09 
 
 
378 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  47.28 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
376 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  47.75 
 
 
369 aa  309  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 
379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  46.17 
 
 
375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 
379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  46.76 
 
 
379 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  45.72 
 
 
365 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  45.21 
 
 
378 aa  308  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  46.74 
 
 
379 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  45.35 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  46.83 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  45.35 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  45.79 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  47.3 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
376 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
376 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
376 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  43.16 
 
 
374 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
376 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
376 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
376 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
376 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
377 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  46.24 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  44.41 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  47.2 
 
 
368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  46.74 
 
 
382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  47.08 
 
 
381 aa  305  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  45.93 
 
 
371 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  47.11 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>