More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1180 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  95.22 
 
 
356 aa  704    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  100 
 
 
356 aa  730    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  96.07 
 
 
359 aa  707    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  48.02 
 
 
370 aa  352  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  47.4 
 
 
386 aa  343  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  48.72 
 
 
370 aa  342  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  47.54 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  46.91 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
386 aa  326  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  49.04 
 
 
379 aa  325  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  48.59 
 
 
374 aa  322  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  48.88 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  44.16 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  47.75 
 
 
380 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  45.73 
 
 
379 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  48.42 
 
 
388 aa  315  6e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.96 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  47.38 
 
 
382 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  47.04 
 
 
375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  44.2 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  46.58 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  46.96 
 
 
377 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  44.2 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  45.3 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  46.2 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  44.81 
 
 
381 aa  301  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  45.94 
 
 
379 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  45.94 
 
 
379 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  45.94 
 
 
379 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  45.94 
 
 
379 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  45.94 
 
 
379 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  45.76 
 
 
376 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  46.96 
 
 
373 aa  300  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
376 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  45.76 
 
 
376 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
376 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  44.86 
 
 
373 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
376 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
376 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
376 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
375 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
365 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  46.44 
 
 
379 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
376 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  46.44 
 
 
379 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.2 
 
 
376 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  46.33 
 
 
374 aa  299  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
376 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  49 
 
 
374 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  45.07 
 
 
378 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  44.2 
 
 
386 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  44.54 
 
 
378 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  44.94 
 
 
377 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  42.5 
 
 
375 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  44.17 
 
 
378 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  45.56 
 
 
397 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  46.67 
 
 
375 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
379 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  43.41 
 
 
376 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  43.54 
 
 
369 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  47.44 
 
 
372 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  46.57 
 
 
366 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  44.72 
 
 
379 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  46.54 
 
 
378 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
380 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  46.29 
 
 
378 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
377 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
382 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  44.66 
 
 
377 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  46.69 
 
 
377 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  45.4 
 
 
379 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  44.32 
 
 
379 aa  290  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  45.56 
 
 
375 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  46.07 
 
 
381 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  44.6 
 
 
375 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  40.46 
 
 
374 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  44.38 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  43.47 
 
 
372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  45.08 
 
 
381 aa  289  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  45.68 
 
 
374 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  42.05 
 
 
374 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  41.37 
 
 
383 aa  288  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  45.05 
 
 
380 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  45.63 
 
 
378 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
374 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  44.92 
 
 
374 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  43.79 
 
 
374 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
374 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
375 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  43.99 
 
 
385 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  45.15 
 
 
377 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  42.39 
 
 
388 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  44.63 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  45.51 
 
 
378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  42.18 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>