More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3504 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  98.13 
 
 		 374 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  100 
 
 		 374 aa  764    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  79.14 
 
 		 372 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  70.74 
 
 		 376 aa  551  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  77.42 
 
 		 372 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  75.27 
 
 		 373 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1403  chaperone protein DnaJ  64.19 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00904898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  60.65 
 
 		 374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  61.62 
 
 		 373 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  60.65 
 
 		 374 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  60.11 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  60.92 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  55.5 
 
 		 378 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  54.13 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  54.13 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  55.5 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  55.91 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  55.38 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  55.11 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  55.65 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  52.56 
 
 		 375 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  56.88 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  52.83 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  55.53 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  52.55 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  52.55 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  52.55 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  52.96 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  53.3 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  57.93 
 
 		 375 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  52.42 
 
 		 375 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  54.72 
 
 		 397 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  58.09 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  57.8 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  56.07 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  58.09 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  51.08 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  54.16 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  52.41 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  54.93 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  55.68 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  52.42 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  51.87 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  51.87 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  52.42 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  54.18 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  52.67 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  52.42 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  54.3 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  54.3 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  54.93 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  54.03 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  57.76 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  52.15 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  52.29 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  52.69 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  52.42 
 
 		 376 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  50.27 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  52.7 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1471  chaperone protein DnaJ  55.87 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00621305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  53.87 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  50.67 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  51.18 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  50.67 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  47.48 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  48.81 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  52.67 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  51.48 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  48.25 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>