More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3390 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  100 
 
 		 375 aa  769    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  83.55 
 
 		 380 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  86.33 
 
 		 376 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  86.02 
 
 		 375 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  75.8 
 
 		 374 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  77.19 
 
 		 377 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  78.51 
 
 		 377 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2042  chaperone protein DnaJ  77.98 
 
 		 377 aa  570  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280436  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  68.25 
 
 		 381 aa  539  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  67.02 
 
 		 372 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  65.05 
 
 		 382 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  67.57 
 
 		 375 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  66.49 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  67.37 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  64.89 
 
 		 385 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  67.92 
 
 		 379 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  67.74 
 
 		 379 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  65.78 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  67.54 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  64.63 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  67.92 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  63.9 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3920  chaperone protein DnaJ  66.13 
 
 		 380 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  68.38 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  65.15 
 
 		 377 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  67.38 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  58.51 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  56.58 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  56.32 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  57.37 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  56.14 
 
 		 385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  57.11 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  55.91 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  56.69 
 
 		 384 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  57.11 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  55 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  56.84 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  55.85 
 
 		 378 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  55.35 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  56 
 
 		 375 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  56.23 
 
 		 378 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  56.23 
 
 		 378 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  52.96 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  56.2 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  56.27 
 
 		 376 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  56.23 
 
 		 378 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  56.23 
 
 		 378 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  56.02 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  55.76 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  56 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  55.29 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  54.33 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  55.76 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  56.15 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  56.15 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  55.76 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  55.76 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  56.23 
 
 		 378 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  54.33 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  55.7 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  54.33 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  56 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  55.76 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  56 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  55.85 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  56.23 
 
 		 378 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1249  chaperone protein DnaJ  57.29 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38744  normal  0.199724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  55.73 
 
 		 376 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  55.73 
 
 		 376 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  55.59 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  55.61 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  55.73 
 
 		 376 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  55.47 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  55.24 
 
 		 377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  55.73 
 
 		 376 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  54.5 
 
 		 380 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  55.05 
 
 		 377 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  54.81 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  56.6 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  54.52 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  55.88 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  53.56 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  52.65 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  53.83 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>