More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0854 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
395 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  81.01 
 
 
395 aa  625  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  72.66 
 
 
394 aa  588  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  71.93 
 
 
395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  71.93 
 
 
400 aa  558  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  71.03 
 
 
382 aa  545  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  74 
 
 
401 aa  541  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  50.38 
 
 
385 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  50.63 
 
 
385 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  48.09 
 
 
379 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  47.51 
 
 
389 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  48.22 
 
 
386 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  47.97 
 
 
388 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  44.42 
 
 
379 aa  343  4e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  46.58 
 
 
386 aa  332  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.82 
 
 
380 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  45.82 
 
 
379 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  43.97 
 
 
386 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.56 
 
 
375 aa  316  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  45.69 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  44.95 
 
 
375 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  42.04 
 
 
388 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  42.46 
 
 
388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  47.18 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
375 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  44.58 
 
 
373 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
379 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 
386 aa  301  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  45.82 
 
 
361 aa  300  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
379 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  44.95 
 
 
374 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  42.75 
 
 
377 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  44.7 
 
 
374 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.18 
 
 
379 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.18 
 
 
379 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  45.01 
 
 
378 aa  299  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.18 
 
 
379 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  43.29 
 
 
377 aa  299  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  42.46 
 
 
384 aa  298  9e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  44.94 
 
 
387 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 
382 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
379 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
379 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  43.69 
 
 
378 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
379 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 
382 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
379 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
379 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
374 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  43.58 
 
 
378 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  44.39 
 
 
382 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  41.65 
 
 
381 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  44.68 
 
 
387 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  41.75 
 
 
376 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  41.75 
 
 
376 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  42.36 
 
 
375 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  45.69 
 
 
374 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  40.15 
 
 
376 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  43.43 
 
 
378 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  43.69 
 
 
376 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
375 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  43.13 
 
 
356 aa  293  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  42.09 
 
 
381 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  40.15 
 
 
379 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  41.81 
 
 
380 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  43.91 
 
 
376 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  43.05 
 
 
385 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.8 
 
 
377 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  43.18 
 
 
376 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  43.4 
 
 
366 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  42.21 
 
 
375 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
377 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  43.15 
 
 
377 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  43.65 
 
 
378 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  42.03 
 
 
382 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  43.15 
 
 
377 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  45.2 
 
 
375 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  42.07 
 
 
376 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
371 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  44.92 
 
 
374 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  43.15 
 
 
377 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  43.07 
 
 
397 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  43.4 
 
 
373 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
380 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  43.4 
 
 
381 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  43.85 
 
 
369 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  43.29 
 
 
377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  43.15 
 
 
389 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  41.35 
 
 
378 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
378 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
378 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  41.35 
 
 
378 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>