More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4905 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  92.16 
 
 		 317 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  95.92 
 
 		 319 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  95.3 
 
 		 319 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  74.29 
 
 		 314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  73.98 
 
 		 314 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  72.01 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  60.75 
 
 		 313 aa  384  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  55.45 
 
 		 306 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  55.14 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  55.14 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  55.14 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  55.14 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  55.14 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  55.14 
 
 		 306 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  54.52 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  54.52 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  54.52 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  54.52 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  55.14 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  54.52 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  54.83 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.62 
 
 		 323 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  55.14 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  51.54 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  47.02 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  47.02 
 
 		 313 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.54 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.71 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  43.52 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  45.72 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  42.41 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.01 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  43.61 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  45.4 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  44.14 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  40.66 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  46.42 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  41.74 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  46.42 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  42.5 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.96 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.37 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  45.08 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  44.13 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.71 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  41.64 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  48.25 
 
 		 310 aa  222  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  48.25 
 
 		 310 aa  222  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  43.75 
 
 		 321 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.03 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  47.35 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  41.54 
 
 		 314 aa  215  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  42.19 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  42.12 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.76 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  39.02 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  44.69 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  44.04 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  45.45 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  45.9 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.01 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.05 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  39.68 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  40.7 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  39.7 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  37.11 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.76 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.76 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  36.56 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.24 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  39.88 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  35.09 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.23 
 
 		 339 aa  195  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  38.42 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  36.84 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  36.09 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.05 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  36.09 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  36.09 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  35.42 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.97 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  44.72 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.24 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  37.24 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  40.38 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.34 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.21 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  35.64 
 
 		 375 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  36.86 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.3 
 
 		 289 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  38.73 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  43.9 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.06 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  34.71 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  35.81 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  35.81 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>