More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1060 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
380 aa  778    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2348  chaperone protein DnaJ  65.7 
 
 
380 aa  485  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1208  chaperone protein DnaJ  66.95 
 
 
373 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.827822  hitchhiker  0.00896971 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  61.62 
 
 
377 aa  464  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  60.05 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  43.32 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 
375 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  44.53 
 
 
373 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
374 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  44.39 
 
 
381 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  45.14 
 
 
379 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  42.63 
 
 
376 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  45.07 
 
 
375 aa  293  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  44 
 
 
356 aa  292  6e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  44.73 
 
 
388 aa  292  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  44.8 
 
 
370 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  45.36 
 
 
383 aa  290  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  43.42 
 
 
376 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
386 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  45.93 
 
 
382 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  44.99 
 
 
386 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  43.52 
 
 
379 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  43.39 
 
 
376 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  44.27 
 
 
380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  42.6 
 
 
395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  42.86 
 
 
356 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  44.85 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  42.53 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  42.6 
 
 
373 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
380 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00161  chaperone protein DnaJ  44.69 
 
 
376 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.296062  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  43.31 
 
 
382 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1344  chaperone protein DnaJ  44.69 
 
 
376 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  42.4 
 
 
377 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0017  chaperone protein DnaJ  43.02 
 
 
374 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.629489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  41.43 
 
 
359 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00161  chaperone protein DnaJ  43.02 
 
 
374 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.453934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
370 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  43.95 
 
 
375 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  42.75 
 
 
374 aa  275  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  40.66 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00161  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.108884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  42.06 
 
 
377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  44.22 
 
 
385 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00161  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 
374 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  41.47 
 
 
375 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 
378 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  41.47 
 
 
375 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
379 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
379 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  42.59 
 
 
375 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
379 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
379 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  43.22 
 
 
384 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
379 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  43.95 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  42.12 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0020  chaperone protein DnaJ  43.02 
 
 
376 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  40.85 
 
 
395 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.78 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.78 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.78 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  44.47 
 
 
376 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
400 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  44.47 
 
 
376 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  44.47 
 
 
376 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  44.47 
 
 
376 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  44.47 
 
 
376 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  44.47 
 
 
376 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  44.47 
 
 
376 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  44.65 
 
 
378 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  44.47 
 
 
376 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1616  chaperone protein DnaJ  42.3 
 
 
352 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  44.65 
 
 
378 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  44.21 
 
 
376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  42.6 
 
 
372 aa  265  7e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
384 aa  265  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  42.49 
 
 
396 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  43.95 
 
 
382 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0024  chaperone protein DnaJ  42.06 
 
 
378 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 
377 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  41.86 
 
 
380 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 
374 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00211  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 
378 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
379 aa  262  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  41.36 
 
 
377 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  43.96 
 
 
366 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
373 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  43.67 
 
 
386 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
378 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
388 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
385 aa  259  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  42.27 
 
 
380 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  42.43 
 
 
387 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 
376 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  40.73 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  43.01 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>