More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2125 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
385 aa  777    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  50.76 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  50.38 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  52.05 
 
 
382 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
385 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  48.73 
 
 
395 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  46.88 
 
 
379 aa  379  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  48.45 
 
 
389 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  47.85 
 
 
395 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  47.14 
 
 
388 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  46.45 
 
 
400 aa  364  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  48.5 
 
 
401 aa  364  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  47.67 
 
 
386 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  45.43 
 
 
379 aa  358  7e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  47.03 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  43.85 
 
 
388 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  44.39 
 
 
368 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  44.68 
 
 
386 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  46.35 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  44.07 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  45.64 
 
 
381 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  45.31 
 
 
382 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
375 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  43.6 
 
 
380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  45.13 
 
 
386 aa  308  8e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  46.51 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  44.27 
 
 
373 aa  305  7e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  46.77 
 
 
375 aa  302  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  43.49 
 
 
377 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  45.08 
 
 
373 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  43.86 
 
 
376 aa  300  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
380 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  45.35 
 
 
384 aa  299  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
381 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  42.04 
 
 
376 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  45.17 
 
 
370 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
356 aa  296  5e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  42.54 
 
 
356 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  46.93 
 
 
376 aa  295  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  41.9 
 
 
375 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  42.45 
 
 
377 aa  292  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  42.98 
 
 
387 aa  292  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  46.21 
 
 
374 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  44.2 
 
 
377 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  42.7 
 
 
387 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  46.48 
 
 
374 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  44.6 
 
 
379 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
379 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  44.6 
 
 
379 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  44.6 
 
 
379 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  45.17 
 
 
370 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  44.6 
 
 
379 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  44.6 
 
 
379 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  44.04 
 
 
376 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  44.04 
 
 
376 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
379 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  41.39 
 
 
374 aa  289  7e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  44.1 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  41.54 
 
 
396 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  44.1 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  44.1 
 
 
378 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 
379 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
376 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 
382 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
377 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  43.85 
 
 
378 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  44.1 
 
 
378 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
388 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
380 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  42.23 
 
 
361 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  46.81 
 
 
375 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  43.59 
 
 
376 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  41.13 
 
 
377 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  45.18 
 
 
374 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  44.65 
 
 
375 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  42.56 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.16 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  44.56 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0027  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  44.13 
 
 
378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  44.01 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  41.16 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>