More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  100 
 
 		 332 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  69.07 
 
 		 325 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  69.14 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3707  chaperone DnaJ domain protein  68.58 
 
 		 337 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.539813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  60.87 
 
 		 334 aa  349  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  56.55 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  57.83 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4231  chaperone DnaJ domain protein  57.31 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  56.72 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  59.04 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  55.49 
 
 		 361 aa  287  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  46.47 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  45.09 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  41.81 
 
 		 390 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 		 391 aa  245  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  42.48 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.59 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  37.66 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.63 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.1 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  39.88 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  37.02 
 
 		 374 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  37.77 
 
 		 373 aa  198  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.5 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.5 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  42.46 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2042  chaperone protein DnaJ  36.78 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280436  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  36.9 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  37.01 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  36.39 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.44 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  41.19 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.87 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.03 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  38.63 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1280  DnaJ domain protein  40.34 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  38.63 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  36 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.83 
 
 		 392 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  35.93 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  35.46 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  38.16 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  38.16 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  38.16 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  38.16 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  38.16 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  40.38 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.274204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.08 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  36.86 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  37.89 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  35.92 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  37.89 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.83 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  39.71 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  38.3 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  40.9 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  34.53 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  34.78 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  34.53 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  36.09 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  40.9 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  35.69 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  35.68 
 
 		 376 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  35.92 
 
 		 388 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.28 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  34.23 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  36.98 
 
 		 320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  38.99 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  36.89 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.23 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  36.78 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  40.63 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  34.9 
 
 		 381 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  36.56 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.38 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.85 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  36.49 
 
 		 372 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  39.94 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.480945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>