More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0087 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
373 aa  756    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  54.89 
 
 
369 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  54.62 
 
 
369 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  46.38 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
381 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
388 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 
384 aa  299  5e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  44.95 
 
 
380 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  44.56 
 
 
388 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
382 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  43.16 
 
 
380 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  43.5 
 
 
379 aa  285  8e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  42.27 
 
 
370 aa  285  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  44.77 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  42.98 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
386 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
379 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  43.63 
 
 
366 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  42.03 
 
 
373 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  42.27 
 
 
370 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  39.95 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  40.05 
 
 
356 aa  271  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
384 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
373 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  45.24 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  39.78 
 
 
356 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  43.4 
 
 
393 aa  268  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  41.26 
 
 
379 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  41.26 
 
 
379 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  41.26 
 
 
379 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
388 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  40.49 
 
 
375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  38.74 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  40.65 
 
 
377 aa  266  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
379 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  41.14 
 
 
381 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  42.32 
 
 
382 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  40.6 
 
 
379 aa  263  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  38.92 
 
 
359 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  39.35 
 
 
375 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  42.01 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  41.16 
 
 
376 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  39.51 
 
 
380 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  40.88 
 
 
376 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  39.3 
 
 
374 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 
373 aa  261  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  41.19 
 
 
374 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  40.88 
 
 
376 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  40.88 
 
 
376 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  40.88 
 
 
376 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
376 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  40.88 
 
 
376 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  40.88 
 
 
376 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  40.88 
 
 
376 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  40.88 
 
 
376 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.27 
 
 
377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  39.46 
 
 
375 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  40.65 
 
 
368 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
371 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
371 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
371 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
371 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
374 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  37.96 
 
 
387 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
371 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  41.99 
 
 
379 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  41.99 
 
 
379 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
371 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  37.67 
 
 
377 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  41.99 
 
 
379 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
371 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  41.99 
 
 
379 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  41.99 
 
 
379 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
371 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
389 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
355 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
371 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  38.38 
 
 
382 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  38.38 
 
 
382 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
378 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  40.06 
 
 
372 aa  256  6e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
375 aa  255  8e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0767  chaperone protein DnaJ  40.88 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  37.7 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  40.06 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  39.67 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  39.56 
 
 
385 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  37.91 
 
 
374 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  38.84 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  39.47 
 
 
395 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
385 aa  252  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  39.94 
 
 
376 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  38.52 
 
 
380 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  39.07 
 
 
382 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>