More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3476 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3476  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00429307  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  37.14 
 
 
294 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  36.13 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  35.95 
 
 
297 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  32.62 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.48 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  51.82 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.61 
 
 
302 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  31.73 
 
 
335 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  34.22 
 
 
375 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  43.9 
 
 
394 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  53.19 
 
 
296 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  30.94 
 
 
339 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  69.7 
 
 
359 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.29 
 
 
325 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  53.93 
 
 
376 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  66.2 
 
 
384 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  49.51 
 
 
377 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.43 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  33.12 
 
 
326 aa  99  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0488  chaperone protein DnaJ  64.29 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  32.76 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  62.16 
 
 
375 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
385 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  65.22 
 
 
387 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  59.21 
 
 
375 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.49 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  49.5 
 
 
374 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  30.33 
 
 
371 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  66.15 
 
 
355 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  54 
 
 
379 aa  95.9  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  33 
 
 
381 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  62.69 
 
 
373 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  31.49 
 
 
333 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.79 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  62.86 
 
 
398 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  47.57 
 
 
382 aa  93.6  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
379 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
379 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  64.29 
 
 
324 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  30.74 
 
 
373 aa  93.6  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  53.68 
 
 
362 aa  93.2  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  55.26 
 
 
385 aa  92.8  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  66.18 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  60 
 
 
400 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  31.15 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  33.33 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  61.19 
 
 
383 aa  92.4  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  45.63 
 
 
335 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  45.63 
 
 
335 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  55.41 
 
 
374 aa  92.4  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  92  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
377 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  59.42 
 
 
385 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  57.97 
 
 
387 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  57.97 
 
 
387 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  52.87 
 
 
391 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  46.73 
 
 
395 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  59.42 
 
 
386 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  48.45 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  56.76 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  56.76 
 
 
379 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  56.76 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  58.11 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  61.43 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  59.15 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  45.63 
 
 
380 aa  91.3  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  59.46 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  56.76 
 
 
380 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  52 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  61.19 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  28.66 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  58.11 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  45.6 
 
 
369 aa  90.5  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  56.76 
 
 
380 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  61.43 
 
 
376 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  55.41 
 
 
379 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  29.49 
 
 
373 aa  90.5  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  59.15 
 
 
380 aa  90.5  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  57.97 
 
 
379 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  45.6 
 
 
369 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  53.95 
 
 
378 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  51.35 
 
 
377 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  56.76 
 
 
382 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  32.55 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>