More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1280 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1280  DnaJ domain protein  100 
 
 		 353 aa  715    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  59.09 
 
 		 341 aa  378  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  40.71 
 
 		 325 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.3 
 
 		 361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  41.3 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  42.64 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  40.63 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3707  chaperone DnaJ domain protein  41.02 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.539813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.25 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  38.94 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  36 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.25 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.81 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.05 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  37.84 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  37.86 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  37.86 
 
 		 335 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.14 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40.74 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.24 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  32.65 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  33.33 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.82 
 
 		 325 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  33.9 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  35.09 
 
 		 390 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.97 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  36.97 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  33.85 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.04 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  35.21 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  31.52 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  33.71 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3589  heat shock protein DnaJ domain protein  35.82 
 
 		 324 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0561803  normal  0.0551979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  37.25 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  33.82 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.48 
 
 		 324 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  34.73 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  36.45 
 
 		 318 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  34.03 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  32.41 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.54 
 
 		 291 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  35.67 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  36.91 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  33.43 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  36.59 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  35.24 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.85 
 
 		 334 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.65 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  32.75 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  32.24 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.11 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  34.29 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  31.28 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  31.39 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  35.76 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.98 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  33.43 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  33.24 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.05 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  31.95 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  31.81 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  31.89 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  33.05 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  34.31 
 
 		 320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.47 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  33.43 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.76 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  29.95 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  32.66 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  31.48 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  30.94 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  30.94 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  30.94 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  30.94 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  31.82 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  30.94 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  34.44 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  31.87 
 
 		 289 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  34.71 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  35.55 
 
 		 313 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  31.11 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  34.67 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  30.98 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.73 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  31.47 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  31.55 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  29.89 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  31.68 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  31.36 
 
 		 295 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  31.37 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  32.32 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>