More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  100 
 
 
338 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  59.36 
 
 
325 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  56.05 
 
 
333 aa  308  9e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  53.98 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3707  chaperone DnaJ domain protein  55.46 
 
 
337 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.539813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  59.12 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  52.51 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  50.97 
 
 
361 aa  265  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  47.11 
 
 
326 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.12 
 
 
328 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  43.34 
 
 
341 aa  229  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  41.87 
 
 
391 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
390 aa  222  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  39.43 
 
 
383 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  39.28 
 
 
335 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  39.28 
 
 
335 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  39.44 
 
 
389 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.02 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  41 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.43 
 
 
315 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  39.34 
 
 
335 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.96 
 
 
325 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  36.68 
 
 
307 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.31 
 
 
324 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  37.43 
 
 
339 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  37.56 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  37.54 
 
 
316 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1280  DnaJ domain protein  41.76 
 
 
353 aa  187  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  41.25 
 
 
315 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  36.67 
 
 
287 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  36.07 
 
 
313 aa  185  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  36.99 
 
 
375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.29 
 
 
324 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.99 
 
 
319 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.01 
 
 
295 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  35.43 
 
 
337 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.47 
 
 
392 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.63 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  34.94 
 
 
313 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  34.94 
 
 
341 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  36.47 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  36.19 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  35.13 
 
 
299 aa  179  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  36.42 
 
 
296 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  37.8 
 
 
323 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.82 
 
 
306 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.82 
 
 
306 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.52 
 
 
306 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.52 
 
 
306 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.52 
 
 
306 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.52 
 
 
306 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
392 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.52 
 
 
306 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
392 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
392 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  39.94 
 
 
336 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.52 
 
 
306 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.11 
 
 
313 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.22 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.64 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  34.33 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  37.89 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  37.26 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  38.91 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.9 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  38.02 
 
 
318 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  38.02 
 
 
318 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.34 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.34 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.34 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.34 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.34 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  35.14 
 
 
333 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  37.72 
 
 
318 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  33.12 
 
 
301 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  38.86 
 
 
318 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  35.93 
 
 
333 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  39.6 
 
 
323 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  32.61 
 
 
382 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  32.61 
 
 
382 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  33.52 
 
 
370 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  41.38 
 
 
294 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  32.59 
 
 
378 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  36.28 
 
 
320 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  38.91 
 
 
307 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  35.41 
 
 
374 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.06 
 
 
317 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  36.07 
 
 
315 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  36.56 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.18 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  35.34 
 
 
373 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  34.58 
 
 
401 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  35.34 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.91 
 
 
289 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  30.27 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.65 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  55.92 
 
 
387 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  30.27 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  35.51 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>