More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1309 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  100 
 
 		 323 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  89.47 
 
 		 323 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  82.1 
 
 		 322 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  82.46 
 
 		 325 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  76.78 
 
 		 319 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  75.23 
 
 		 320 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  72.45 
 
 		 316 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.18 
 
 		 323 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  50.15 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.31 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  45.08 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.25 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  47.47 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  47.8 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.33 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  47.69 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  47.38 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  42.42 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.47 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  41.67 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.39 
 
 		 392 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  41.05 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  40.74 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  39.34 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  41.82 
 
 		 305 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4811  heat shock protein DnaJ domain protein  49.84 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0626175  normal  0.377738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  42.9 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.31 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  40.3 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  36.92 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  39.55 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.17 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.24 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.31 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.31 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.98 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  37.35 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  36.05 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  38.84 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.17 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.17 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.17 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.17 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.17 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.17 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  36.86 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.17 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  35.51 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.56 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.08 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.99 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  36.62 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  40.07 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.76 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.24 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  34.42 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  35.69 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  35.69 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  35.69 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  35.69 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  35.69 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.81 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  34.39 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.39 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.22 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.69 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.63 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  34.51 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.44 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  37.65 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.44 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.68 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.04 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.99 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  39.56 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  37.62 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  38.69 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  35.52 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.75 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  35.19 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.58 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  36.89 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  32.92 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  31.89 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.31 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  37.78 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  33.81 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.89 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.08 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  32.31 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  33.03 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  38.16 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.46 
 
 		 283 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  32.82 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.35 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  31.15 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  33.82 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.93 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>