More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0261 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
324 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  48.16 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  48.31 
 
 
313 aa  302  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.06 
 
 
315 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  46.44 
 
 
315 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  46.01 
 
 
327 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  48.77 
 
 
326 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.3 
 
 
325 aa  292  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  49.7 
 
 
313 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  45.15 
 
 
315 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  49.85 
 
 
313 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  47.6 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  51.86 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  51.86 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  50.6 
 
 
328 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  46.58 
 
 
321 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.38 
 
 
326 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  47.24 
 
 
326 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.17 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  44.04 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  50.15 
 
 
315 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  47.84 
 
 
314 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  45.29 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.88 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.81 
 
 
307 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  46.42 
 
 
304 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.38 
 
 
324 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  42.44 
 
 
324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.46 
 
 
317 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  41.55 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  41.43 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.34 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  46.27 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  44.86 
 
 
304 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  42.9 
 
 
314 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.67 
 
 
319 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  44.38 
 
 
320 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  43.48 
 
 
297 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.2 
 
 
319 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  47.52 
 
 
316 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  41.67 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.63 
 
 
323 aa  232  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  39.02 
 
 
335 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  42.12 
 
 
331 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  48.33 
 
 
319 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.33 
 
 
351 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  42.2 
 
 
319 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.82 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.2 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.91 
 
 
316 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  44.12 
 
 
340 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  39.26 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  39.26 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  39.26 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  39.26 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  39.26 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.16 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.53 
 
 
325 aa  222  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  40.69 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  40.24 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  40.81 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.64 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  39.13 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  44.71 
 
 
318 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  38.34 
 
 
306 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  38.34 
 
 
306 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.64 
 
 
318 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.65 
 
 
324 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.43 
 
 
339 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  38.04 
 
 
306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  38.04 
 
 
306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  38.04 
 
 
306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  38.04 
 
 
306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  38.04 
 
 
306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.97 
 
 
315 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  41.19 
 
 
296 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  38.04 
 
 
306 aa  216  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  39.42 
 
 
299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  37.5 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  37.73 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  41.19 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  42.36 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  39.37 
 
 
340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  41.98 
 
 
316 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  38.12 
 
 
311 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.32 
 
 
297 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  40.18 
 
 
295 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  37.36 
 
 
333 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.61 
 
 
331 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.66 
 
 
330 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  36.52 
 
 
337 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  36.34 
 
 
370 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.85 
 
 
287 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  37.54 
 
 
333 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  35.94 
 
 
335 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  37.68 
 
 
333 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  39.2 
 
 
297 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>