More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2100 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 		 320 aa  660    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.94 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  53.87 
 
 		 313 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.68 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  52.32 
 
 		 319 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.32 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  54.94 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  54.01 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.21 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  50.3 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  50.3 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  50.3 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  50.3 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  50.3 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  49.7 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  49.7 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  50 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  49.39 
 
 		 306 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  48.61 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  48.61 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  48.61 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  48.61 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  48.61 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  51.85 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  51.24 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  45.82 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  45.82 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.31 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.17 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.87 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  45.28 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  41.41 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  44.94 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  41.98 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  43.3 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  44.94 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.8 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  39.51 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.12 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  41.05 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  40.79 
 
 		 330 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  40.98 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  39.02 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  43.61 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  43.61 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  41.61 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  41.59 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.12 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  39.51 
 
 		 326 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  41.38 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.34 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.74 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  38.92 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.39 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.45 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  40.75 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  37.39 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  40.37 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  39.75 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.69 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.63 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  42.24 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  40.57 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  39.7 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  40.79 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.34 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.7 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.87 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  41.62 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.77 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  34.68 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  36.47 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  35 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.35 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  40.81 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  39.32 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.96 
 
 		 334 aa  189  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  37.07 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.67 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.03 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  34.03 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  35.08 
 
 		 380 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  34.2 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  36.74 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  33.89 
 
 		 375 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  35.53 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.76 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  36.34 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  38.65 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  34.9 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.26 
 
 		 283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  35.73 
 
 		 379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  34.01 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  35.73 
 
 		 379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  36.34 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  38.73 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 		 387 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  32.77 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  35.73 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>