More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1124 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
326 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  92.33 
 
 
326 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  56.57 
 
 
315 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  55.83 
 
 
313 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  54.38 
 
 
327 aa  347  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  55.35 
 
 
315 aa  345  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.6 
 
 
313 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  55.69 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.13 
 
 
325 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  55.52 
 
 
313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  53.68 
 
 
321 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.02 
 
 
323 aa  322  7e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  52.15 
 
 
308 aa  319  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  48.32 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  48.32 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.06 
 
 
315 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  46.2 
 
 
320 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
331 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  49.39 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  47.56 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.38 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.6 
 
 
331 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.48 
 
 
347 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.77 
 
 
324 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.18 
 
 
313 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  46.91 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  46.91 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.12 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  43.9 
 
 
295 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  45.43 
 
 
316 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  40.43 
 
 
313 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  45.37 
 
 
304 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  41.36 
 
 
297 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  40.37 
 
 
330 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  41.12 
 
 
296 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  42.9 
 
 
314 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  40.5 
 
 
296 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  42.6 
 
 
314 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  39.94 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.02 
 
 
317 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.07 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.99 
 
 
339 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.73 
 
 
316 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  38.77 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  38.77 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  38.77 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  38.77 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  38.77 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  38.77 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  41.3 
 
 
313 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 
324 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.68 
 
 
335 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  38.15 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  38.46 
 
 
306 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  38.46 
 
 
306 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  38.58 
 
 
306 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  38.58 
 
 
306 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  38.58 
 
 
306 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  38.58 
 
 
306 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  38.58 
 
 
306 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  41.61 
 
 
314 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  39.94 
 
 
304 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0039  heat shock protein DnaJ  40.12 
 
 
332 aa  206  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.37 
 
 
324 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  42.86 
 
 
293 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  41.28 
 
 
316 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.57 
 
 
289 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.65 
 
 
334 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  42.32 
 
 
299 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.4 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.57 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  40.75 
 
 
337 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  39.52 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  41.47 
 
 
328 aa  199  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  39.7 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  37.17 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  40.95 
 
 
319 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.39 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  39.81 
 
 
309 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.74 
 
 
301 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  36.39 
 
 
333 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  38.72 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.48 
 
 
316 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  35.24 
 
 
339 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38 
 
 
287 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.12 
 
 
287 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  38.84 
 
 
309 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  37.23 
 
 
307 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3589  heat shock protein DnaJ domain protein  39.51 
 
 
324 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0561803  normal  0.0551979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.95 
 
 
318 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  38.42 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.14 
 
 
351 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  38.62 
 
 
331 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  36.05 
 
 
337 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  34.93 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  34.93 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
382 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  39.46 
 
 
318 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  35.8 
 
 
376 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>