More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3860 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  100 
 
 		 309 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  75.32 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  75.32 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  75.65 
 
 		 306 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  75.32 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  75.32 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  75.32 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  75.32 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  75 
 
 		 306 aa  478  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  74.68 
 
 		 306 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  73.05 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  73.05 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  73.05 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  73.05 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  73.05 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  55.66 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  55.38 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.15 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  54.57 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  57.46 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.57 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  57.46 
 
 		 314 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.13 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  53.63 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  52.47 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.61 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  47.94 
 
 		 313 aa  254  9e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  47.94 
 
 		 341 aa  254  9e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  44.73 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  44.55 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  42.86 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.6 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  46.38 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.57 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  46.05 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  42.95 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  46.15 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  46.15 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  42.54 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  41.74 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.53 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  41.25 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  42.63 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.31 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  43.37 
 
 		 304 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  41.18 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  44.62 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  43.27 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.38 
 
 		 323 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.12 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  40.51 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  40.74 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.13 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  40.84 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.99 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  37.14 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  40.51 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  40.89 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.05 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.52 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.25 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  39.38 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.32 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.37 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  36.08 
 
 		 378 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.05 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  33.6 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  34.76 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.51 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  41.46 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  40.62 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  40.18 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  35.51 
 
 		 379 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  35.51 
 
 		 379 aa  178  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  35.51 
 
 		 379 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  37.74 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.7 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  33.05 
 
 		 373 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 		 376 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 		 376 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 		 376 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  34.96 
 
 		 376 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  38.54 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.01 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  36.01 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.67 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  34.55 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  33.43 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  32.7 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  35.42 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  34.39 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  35.33 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  32.59 
 
 		 379 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  32.59 
 
 		 379 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  36.62 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>