More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2674 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
309 aa  628  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  64.29 
 
 
301 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  64.82 
 
 
303 aa  358  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  60.66 
 
 
291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  63.4 
 
 
306 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  53.75 
 
 
299 aa  320  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  57.89 
 
 
293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.08 
 
 
289 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  38.54 
 
 
311 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.71 
 
 
287 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  41.12 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  38.66 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.98 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.59 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.26 
 
 
316 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  35.95 
 
 
324 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.36 
 
 
330 aa  208  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  38.24 
 
 
341 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  36.53 
 
 
307 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  38.24 
 
 
313 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  37.74 
 
 
287 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.28 
 
 
334 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.01 
 
 
315 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  39.46 
 
 
330 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  40.85 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  41.3 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  40.96 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
320 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  35.85 
 
 
313 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  37.8 
 
 
331 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.03 
 
 
319 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.38 
 
 
283 aa  192  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  40.97 
 
 
297 aa  191  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  34.97 
 
 
302 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  35.26 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.96 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  38.63 
 
 
314 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  34.16 
 
 
315 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  33.54 
 
 
326 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.78 
 
 
297 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  38.25 
 
 
330 aa  185  8e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  38.26 
 
 
299 aa  185  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  33.13 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  36.45 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  32.39 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  34.48 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.17 
 
 
306 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.17 
 
 
306 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.17 
 
 
306 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.17 
 
 
306 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.17 
 
 
306 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  36.21 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.64 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.17 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  38.51 
 
 
328 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  36.13 
 
 
297 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  31.83 
 
 
335 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  37.11 
 
 
313 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  33.86 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  36.56 
 
 
324 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  36.25 
 
 
297 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  33.86 
 
 
306 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  33.86 
 
 
306 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  33.86 
 
 
306 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  33.86 
 
 
306 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  33.86 
 
 
306 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  35.13 
 
 
308 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  36.94 
 
 
298 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.54 
 
 
315 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.36 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.3 
 
 
291 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.28 
 
 
331 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  35.35 
 
 
312 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  31.81 
 
 
373 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  33.54 
 
 
306 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  34.91 
 
 
315 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  31.42 
 
 
333 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  33.73 
 
 
333 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.39 
 
 
316 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.47 
 
 
392 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  32.45 
 
 
339 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  33.54 
 
 
320 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  35.58 
 
 
309 aa  176  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  37.96 
 
 
326 aa  175  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  37.33 
 
 
311 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  37.03 
 
 
321 aa  175  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  35.73 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0791  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.43 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000179186  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.43 
 
 
325 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  37.5 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  34.08 
 
 
366 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  38.6 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.94 
 
 
323 aa  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1165  chaperone protein DnaJ  33.05 
 
 
372 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  32.92 
 
 
326 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  37.69 
 
 
313 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  34.3 
 
 
316 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  34.92 
 
 
314 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  30.77 
 
 
379 aa  169  4e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  36.9 
 
 
336 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>