More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1086 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 		 324 aa  630  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  68.92 
 
 		 323 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  51.8 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  50.59 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  53.31 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  51.64 
 
 		 319 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  51.04 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  47.15 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.06 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  50.16 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  48.06 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.51 
 
 		 392 aa  252  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  50.16 
 
 		 302 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  46.46 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  46.98 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  46.67 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.64 
 
 		 308 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  45 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.78 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  42.25 
 
 		 333 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.52 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  43.21 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.39 
 
 		 318 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  42.28 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  43.16 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  43.3 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  41.16 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  41.54 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.61 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.49 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  43.73 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.65 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.65 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  36.06 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.54 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.01 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.28 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  35.76 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.6 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.64 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  37.13 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.12 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.46 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.64 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.96 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  34.62 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  34.62 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  34.62 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  34.62 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.62 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  53.76 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  34.62 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  34.62 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  34.62 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  42.26 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  34.62 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.17 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  40.06 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  38.87 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.47 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  39.94 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  38.87 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  37.24 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  34.57 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.92 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  36.68 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  38.62 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  35.65 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.12 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  35.36 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.08 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  40.06 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  38.05 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  32.54 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.3 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  32.54 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  32.54 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  32.54 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  32.54 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.23 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  33.99 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  32.85 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  35.19 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  38.7 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  37.27 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  34.25 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  36.73 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  33.53 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  36.8 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  40.26 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  37.13 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.46 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  40.58 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  40.78 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.19 
 
 		 334 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.57 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  40.65 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.92 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>