More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4767 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  61.3 
 
 
305 aa  338  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  53.52 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  44.69 
 
 
336 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  45.9 
 
 
326 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  46.01 
 
 
323 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0049  heat shock protein DnaJ-like  65.71 
 
 
325 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.43 
 
 
317 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  41.07 
 
 
303 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.62 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  44.17 
 
 
319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.74 
 
 
392 aa  215  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  43.79 
 
 
301 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  44.18 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  43.2 
 
 
324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  47.11 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  44.51 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.95 
 
 
320 aa  208  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  43.83 
 
 
316 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.23 
 
 
313 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.41 
 
 
308 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  45.06 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  44.75 
 
 
313 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  39.12 
 
 
299 aa  198  9e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  39.76 
 
 
333 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.37 
 
 
316 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  42.36 
 
 
302 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  39.08 
 
 
304 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  36.92 
 
 
333 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  35.06 
 
 
335 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  35.34 
 
 
335 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.31 
 
 
318 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  37.89 
 
 
304 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  43.09 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  35.34 
 
 
339 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.81 
 
 
306 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  41.72 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.75 
 
 
304 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.5 
 
 
326 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.82 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.86 
 
 
325 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.54 
 
 
294 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.89 
 
 
324 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.32 
 
 
292 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  35.54 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.19 
 
 
297 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  35.53 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  33.94 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  35.2 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  38.84 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.89 
 
 
294 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  38.54 
 
 
315 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 
312 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.9 
 
 
324 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.51 
 
 
324 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.18 
 
 
320 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  37.69 
 
 
326 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  37.01 
 
 
371 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.09 
 
 
311 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  33.12 
 
 
333 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  33.81 
 
 
340 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  35.17 
 
 
374 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  47.09 
 
 
320 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  33.94 
 
 
337 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  35.17 
 
 
391 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  32.28 
 
 
370 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  33.04 
 
 
375 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  35.73 
 
 
373 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  34.88 
 
 
374 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  38.21 
 
 
318 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.65 
 
 
341 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  36.07 
 
 
390 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  37.91 
 
 
295 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  37.1 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  34.97 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.14 
 
 
313 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  31.76 
 
 
335 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  34.53 
 
 
299 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  32.35 
 
 
287 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  38.92 
 
 
335 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.46 
 
 
319 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  33.62 
 
 
330 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.94 
 
 
334 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  30.86 
 
 
372 aa  151  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  38.33 
 
 
336 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  36.62 
 
 
302 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  35.67 
 
 
366 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  31.56 
 
 
333 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  37.38 
 
 
325 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.86 
 
 
317 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  36.06 
 
 
377 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.11 
 
 
283 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.65 
 
 
334 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  33.99 
 
 
296 aa  149  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  38.05 
 
 
315 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.61 
 
 
318 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.61 
 
 
318 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.47 
 
 
315 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  32.48 
 
 
395 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  33.82 
 
 
381 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>