More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0787 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
292 aa  584  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  45 
 
 
392 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  43.88 
 
 
301 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  45.85 
 
 
336 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  41.97 
 
 
326 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  40.37 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.11 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  42.09 
 
 
303 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  40.65 
 
 
333 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.43 
 
 
323 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  41.16 
 
 
305 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.53 
 
 
304 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.07 
 
 
316 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  40.07 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  36.67 
 
 
323 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  38.74 
 
 
304 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.12 
 
 
306 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.01 
 
 
313 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  34.05 
 
 
325 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  39.16 
 
 
310 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  35.2 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  36.31 
 
 
316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  35.78 
 
 
313 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.01 
 
 
341 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.19 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  35.69 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.51 
 
 
313 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.45 
 
 
308 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  35.78 
 
 
315 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.62 
 
 
315 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  37.76 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.09 
 
 
317 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  38.28 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.66 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  34.07 
 
 
320 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.44 
 
 
317 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  33.44 
 
 
294 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  33.44 
 
 
324 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  32.16 
 
 
311 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.53 
 
 
319 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  31.93 
 
 
311 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  34.84 
 
 
313 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  35.26 
 
 
315 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  31.12 
 
 
333 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  35.76 
 
 
326 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  33.44 
 
 
294 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.01 
 
 
334 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  32.49 
 
 
316 aa  155  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  33.96 
 
 
327 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  34.63 
 
 
313 aa  155  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  35.64 
 
 
296 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  43.79 
 
 
322 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.05 
 
 
323 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  37.09 
 
 
310 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  33.98 
 
 
306 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.83 
 
 
312 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  31.49 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  34.73 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  31.49 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  31.49 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  31.49 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  31.49 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  34.34 
 
 
325 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  32.88 
 
 
297 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.19 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  34.41 
 
 
306 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  34.41 
 
 
306 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  34.41 
 
 
306 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  34.41 
 
 
306 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  36.88 
 
 
318 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  34.41 
 
 
306 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  36.25 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  38.79 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  33.87 
 
 
313 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  35.23 
 
 
304 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  34.41 
 
 
306 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  43.35 
 
 
320 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  35.31 
 
 
296 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.36 
 
 
328 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  33.55 
 
 
313 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  36.82 
 
 
297 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  32.04 
 
 
335 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  32.8 
 
 
313 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0049  heat shock protein DnaJ-like  46.01 
 
 
325 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.01 
 
 
320 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  32.23 
 
 
333 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  36.65 
 
 
318 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  32.65 
 
 
299 aa  149  8e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  36.65 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  34.29 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  34.28 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.02 
 
 
319 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  36.36 
 
 
295 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.9 
 
 
289 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  33.01 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.96 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  32.03 
 
 
330 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4293  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.87 
 
 
316 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>