More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0974 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
316 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  56.63 
 
 
336 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.35 
 
 
392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  49.03 
 
 
303 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  47.87 
 
 
333 aa  279  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  49.04 
 
 
301 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  48.54 
 
 
304 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  48.87 
 
 
304 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.27 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  47.37 
 
 
307 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  46.47 
 
 
326 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.42 
 
 
297 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.63 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.69 
 
 
320 aa  225  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  46.25 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.38 
 
 
313 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  42.33 
 
 
324 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.67 
 
 
323 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  42.01 
 
 
310 aa  202  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.61 
 
 
341 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.61 
 
 
313 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.8 
 
 
317 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  37.31 
 
 
323 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.42 
 
 
292 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  37.27 
 
 
322 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  41.78 
 
 
302 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.13 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  36.28 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  36.2 
 
 
325 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  38.36 
 
 
325 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  39.37 
 
 
313 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  39.37 
 
 
313 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  37.12 
 
 
323 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  35.85 
 
 
316 aa  175  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.59 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  34.48 
 
 
297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  39.3 
 
 
318 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.37 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  36.84 
 
 
299 aa  172  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.82 
 
 
325 aa  172  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.04 
 
 
324 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  38.98 
 
 
318 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.58 
 
 
315 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.89 
 
 
315 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  34.88 
 
 
320 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  36.02 
 
 
335 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  38.66 
 
 
318 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  34.54 
 
 
287 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  36.53 
 
 
320 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.38 
 
 
324 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  33.82 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  36.89 
 
 
326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.01 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  32.1 
 
 
333 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  33.97 
 
 
294 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.08 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  32.75 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.29 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.72 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  37.86 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  36.25 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  33.72 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.22 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.11 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  33.33 
 
 
301 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  38.59 
 
 
315 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.45 
 
 
311 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  35.93 
 
 
309 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  33.88 
 
 
299 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  37.54 
 
 
294 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.66 
 
 
317 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  37.27 
 
 
330 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.05 
 
 
287 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  30.95 
 
 
337 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.37 
 
 
319 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  33.33 
 
 
307 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  33.03 
 
 
306 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  33.03 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  34.23 
 
 
327 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  32.37 
 
 
311 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  32.72 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  32.72 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  32.72 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  32.72 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  32.72 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  38.75 
 
 
315 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  33.82 
 
 
374 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  32.72 
 
 
306 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  31.8 
 
 
306 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  31.8 
 
 
306 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.33 
 
 
315 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  31.8 
 
 
306 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  31.8 
 
 
306 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  31.8 
 
 
306 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  32.05 
 
 
311 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  38.38 
 
 
313 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  30.48 
 
 
372 aa  154  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  31.78 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  31.03 
 
 
401 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.34 
 
 
313 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>