More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1207 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  100 
 
 
323 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  89.47 
 
 
323 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  81.54 
 
 
325 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  80.92 
 
 
322 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  76.78 
 
 
319 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  75.62 
 
 
320 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  74.92 
 
 
316 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.94 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.45 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  51.51 
 
 
324 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.52 
 
 
308 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  43.6 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  48.57 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  46.67 
 
 
302 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  46.18 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.47 
 
 
318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  45.87 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  41.77 
 
 
333 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.8 
 
 
392 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.92 
 
 
312 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  42.11 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  39.52 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4811  heat shock protein DnaJ domain protein  50.82 
 
 
314 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0626175  normal  0.377738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  42.77 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  40.87 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.82 
 
 
328 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  40.24 
 
 
301 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  41.16 
 
 
307 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  40.48 
 
 
310 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.87 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.21 
 
 
324 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  41.58 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.44 
 
 
313 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.59 
 
 
320 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  38.51 
 
 
313 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  38.51 
 
 
341 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  38.25 
 
 
315 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  37.04 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.13 
 
 
304 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.29 
 
 
315 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.42 
 
 
324 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  35.76 
 
 
333 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  38.54 
 
 
301 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  35.71 
 
 
287 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  36.53 
 
 
313 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.12 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  34.81 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  35.92 
 
 
340 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.71 
 
 
335 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.26 
 
 
320 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  36.31 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  36.31 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  36.31 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  36.31 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  36.31 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.56 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  33.63 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  38.87 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.26 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.61 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.08 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.17 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  34.44 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  34.44 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.84 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  34.44 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  34.44 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.57 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.88 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  34.44 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  40 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.95 
 
 
306 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  36.47 
 
 
296 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.93 
 
 
313 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  37 
 
 
313 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  33.75 
 
 
297 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.04 
 
 
315 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.98 
 
 
319 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.98 
 
 
314 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.46 
 
 
315 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  36.17 
 
 
296 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.89 
 
 
326 aa  170  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.73 
 
 
292 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.12 
 
 
289 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  32.76 
 
 
335 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  38.64 
 
 
333 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  37.39 
 
 
314 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  32.76 
 
 
335 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.38 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  32.52 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.24 
 
 
319 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.05 
 
 
316 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.5 
 
 
318 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  35.98 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  32.4 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 
333 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  37.23 
 
 
325 aa  165  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  36.73 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  35.8 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>