More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0767 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  100 
 
 
319 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  86.52 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  78.02 
 
 
323 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  75.23 
 
 
323 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  76 
 
 
325 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  72 
 
 
322 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  76.4 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.69 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  51.05 
 
 
324 aa  269  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.93 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  47.95 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.48 
 
 
308 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  45.83 
 
 
302 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  42.99 
 
 
299 aa  237  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  48.14 
 
 
313 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.12 
 
 
392 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.22 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  42.59 
 
 
305 aa  218  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  42.06 
 
 
304 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  40.18 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  41.82 
 
 
333 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.44 
 
 
313 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  39.25 
 
 
301 aa  208  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  39.2 
 
 
303 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.04 
 
 
312 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.65 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.65 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.38 
 
 
306 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  39.39 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  41.53 
 
 
307 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.14 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  41.25 
 
 
326 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.63 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  38.1 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.89 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.89 
 
 
306 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.8 
 
 
306 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.58 
 
 
306 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.58 
 
 
306 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.58 
 
 
306 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.58 
 
 
306 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.58 
 
 
306 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  35.96 
 
 
333 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
325 aa  185  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.23 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  34.06 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.97 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.3 
 
 
313 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  35.51 
 
 
336 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  34.62 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  35.91 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.61 
 
 
324 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  35.17 
 
 
313 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
333 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.11 
 
 
320 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.01 
 
 
317 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.39 
 
 
304 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.67 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.67 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.67 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.67 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.67 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  33.82 
 
 
335 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  36.2 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.44 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  34.72 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.24 
 
 
319 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  35 
 
 
294 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.8 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  33.33 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.71 
 
 
301 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.28 
 
 
311 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  36.94 
 
 
319 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.56 
 
 
295 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.43 
 
 
323 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.37 
 
 
320 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  34.83 
 
 
314 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.06 
 
 
294 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  35.67 
 
 
339 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  37.86 
 
 
294 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.52 
 
 
335 aa  168  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  39.24 
 
 
325 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  37.43 
 
 
313 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.33 
 
 
324 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.4 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  35.65 
 
 
297 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.93 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  33.93 
 
 
314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  33.54 
 
 
296 aa  165  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  34.05 
 
 
296 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  37.97 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  33.12 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.22 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.44 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  32.19 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  33.66 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  35.09 
 
 
320 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  38.36 
 
 
318 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  33.74 
 
 
296 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>