More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1138 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  100 
 
 		 325 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  82.82 
 
 		 323 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  76.76 
 
 		 322 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  81.23 
 
 		 323 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  76.31 
 
 		 319 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  75.77 
 
 		 316 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  74.69 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.75 
 
 		 323 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  50.3 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.33 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.25 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  47.02 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  45.08 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  48.46 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  41.16 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  42.51 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  41.69 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.29 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4293  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.53 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.7 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4662  heat shock protein DnaJ domain protein  49.21 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201642 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  41.59 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  42.22 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.81 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  38.84 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  39.58 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  39.22 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.5 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  41.69 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.81 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  41.08 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.2 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  36.09 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  36.92 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.97 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  36.26 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.38 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.25 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  36.42 
 
 		 315 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  39.17 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.17 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  34.99 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 		 325 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  36.67 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  38.69 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  32.94 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.86 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.59 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.18 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.23 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  37.72 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  35.48 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.19 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  35.55 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  36.22 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  41.72 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  32.41 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.02 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  35.24 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  35.85 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  33.82 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.34 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  33.02 
 
 		 294 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  33.13 
 
 		 287 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.69 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.15 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  34.04 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  35.4 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  34.66 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  34.97 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  36.01 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  33.73 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  33.73 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  31.83 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  33.73 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  33.73 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  33.73 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  34.04 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  34.04 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  34.04 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  31.7 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  34.04 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  34.04 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  34.04 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  34.94 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  33.94 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.06 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  31.41 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  35.53 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  32.41 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  37.58 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.5 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.38 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.06 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  35.04 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  31.61 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  33.43 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>