More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3908 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  59.6 
 
 		 336 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  54.93 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  55.45 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  53.47 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.32 
 
 		 392 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.68 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  48.57 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.55 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  52 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.83 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  49.5 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  44.37 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.21 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.37 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  40.06 
 
 		 323 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  38.34 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  39.63 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  39.44 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.54 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  41.69 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.22 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.42 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.66 
 
 		 313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.66 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  38.83 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  39.48 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  38.51 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.98 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  36.45 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  39.2 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.59 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  35.56 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  33.84 
 
 		 339 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  37.78 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  34.13 
 
 		 333 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.13 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.9 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2579  heat shock protein DnaJ-like  37.58 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  40.4 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  36.7 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.51 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.96 
 
 		 325 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  38.02 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  33.75 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.3 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  34.11 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  33.15 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  35.22 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.88 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  35.76 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  32.36 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  36.16 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  37.58 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  34.07 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.55 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.62 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  35.62 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  32.69 
 
 		 311 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.2 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  35.09 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  34.7 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  37.14 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  37.41 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  35.17 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  32.15 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  38.49 
 
 		 315 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  38.78 
 
 		 318 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  34.39 
 
 		 315 aa  158  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  38.34 
 
 		 318 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  32.65 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  34.14 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  36.39 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  35.38 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.34 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  35.35 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  34.04 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0663  chaperone DnaJ domain protein  35.79 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  37.46 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  35.15 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.39 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  34.49 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  37.86 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.33 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  34.49 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  33.01 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  35.02 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  35.71 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  34.48 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  34.18 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  34.18 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  34.18 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  44.19 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  34.18 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>