More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0663 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0663  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
310 aa  621  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  39.94 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  39.94 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  42.49 
 
 
315 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  38.6 
 
 
333 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  41.07 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  40.82 
 
 
316 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  38.97 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  37.79 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  42.36 
 
 
297 aa  196  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  38.61 
 
 
297 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  37.24 
 
 
333 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.82 
 
 
341 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.82 
 
 
313 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.56 
 
 
325 aa  192  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.28 
 
 
334 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  36.76 
 
 
339 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  35.82 
 
 
337 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.09 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.39 
 
 
335 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  37.09 
 
 
333 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  38.59 
 
 
296 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.03 
 
 
324 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  37.25 
 
 
294 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  35.91 
 
 
333 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  36.93 
 
 
294 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 
324 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  35.67 
 
 
287 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  37.26 
 
 
304 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.57 
 
 
289 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.11 
 
 
319 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  40.31 
 
 
319 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.88 
 
 
313 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  35.2 
 
 
315 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  39.33 
 
 
318 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  36.31 
 
 
318 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.71 
 
 
318 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  36.28 
 
 
318 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  35.81 
 
 
301 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.89 
 
 
311 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  34.09 
 
 
401 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  35.26 
 
 
374 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.87 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  34.99 
 
 
374 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.1 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  34.29 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.57 
 
 
287 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.17 
 
 
320 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.86 
 
 
324 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  36.07 
 
 
370 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.78 
 
 
324 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.26 
 
 
313 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  38.73 
 
 
302 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  39.69 
 
 
336 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.99 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.99 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.35 
 
 
306 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.99 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.99 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.99 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.99 
 
 
306 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  33.12 
 
 
311 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.99 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  35.58 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  35.58 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  35.58 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  36.48 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  35.58 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  35.58 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  39.29 
 
 
294 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.84 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.04 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  36.18 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.77 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  35.8 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  34.3 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.28 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  32.22 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.66 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.67 
 
 
306 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  33.12 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  30.75 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.81 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.34 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.15 
 
 
314 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  35.05 
 
 
315 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.83 
 
 
330 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  30.23 
 
 
394 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  35.96 
 
 
333 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.66 
 
 
315 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  38.32 
 
 
328 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  37.33 
 
 
333 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  37.5 
 
 
301 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 
381 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.6 
 
 
392 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.48 
 
 
315 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  34.66 
 
 
325 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  38.06 
 
 
294 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  34.21 
 
 
299 aa  158  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  35.42 
 
 
310 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>