More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2940 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  89.81 
 
 
324 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  77.85 
 
 
311 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  53.75 
 
 
331 aa  289  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.35 
 
 
334 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  45.82 
 
 
287 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.95 
 
 
287 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.71 
 
 
289 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  40.07 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  40.67 
 
 
307 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  41.09 
 
 
330 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  41.11 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  45.42 
 
 
313 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.43 
 
 
330 aa  211  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.87 
 
 
316 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  40.07 
 
 
299 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  39.05 
 
 
314 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.42 
 
 
317 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  41.42 
 
 
330 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.69 
 
 
339 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.62 
 
 
302 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.81 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  39.14 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  39.14 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  40.98 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  38.84 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  38.84 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  38.84 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  38.84 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  38.84 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  38.84 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  38.59 
 
 
293 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  40.42 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  38.53 
 
 
306 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  41.77 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.68 
 
 
317 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  39.81 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.8 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  39.81 
 
 
341 aa  195  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  38.91 
 
 
291 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.43 
 
 
320 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  39.16 
 
 
335 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.38 
 
 
291 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  40.67 
 
 
315 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.03 
 
 
324 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  38.18 
 
 
340 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.17 
 
 
325 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  38.59 
 
 
309 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  42.95 
 
 
318 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.73 
 
 
295 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  42.19 
 
 
318 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  42.62 
 
 
318 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  40.77 
 
 
318 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  40.13 
 
 
316 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  40.95 
 
 
320 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.68 
 
 
324 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.77 
 
 
325 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.87 
 
 
315 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  35.96 
 
 
341 aa  186  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  40.49 
 
 
314 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  39.09 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.1 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  34.62 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  40.68 
 
 
314 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  36.42 
 
 
340 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.14 
 
 
313 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  38.87 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  36.28 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  36.28 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.18 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  38.76 
 
 
303 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  33.82 
 
 
337 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.58 
 
 
319 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  40.19 
 
 
304 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
306 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  37.61 
 
 
314 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  39.23 
 
 
297 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  39.23 
 
 
297 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.59 
 
 
334 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  35.35 
 
 
333 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  37.54 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  36 
 
 
392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  36.9 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  39.3 
 
 
309 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  36.96 
 
 
299 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 
381 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  35.62 
 
 
315 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  39.81 
 
 
308 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  35.67 
 
 
315 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  37.82 
 
 
298 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 
377 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  38.08 
 
 
324 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  30.03 
 
 
381 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  35.14 
 
 
370 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  35.05 
 
 
313 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>