More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5061 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
303 aa  621  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  68.54 
 
 
301 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  65.35 
 
 
309 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  61.06 
 
 
299 aa  358  9e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  64.12 
 
 
291 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  56.9 
 
 
293 aa  315  8e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  56.25 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  42.33 
 
 
287 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  39.56 
 
 
313 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  39.56 
 
 
341 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.64 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  38.06 
 
 
311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  41.67 
 
 
331 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.45 
 
 
289 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.06 
 
 
302 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.66 
 
 
324 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 
330 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.99 
 
 
307 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.45 
 
 
287 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  36.97 
 
 
324 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  40.68 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  38.89 
 
 
315 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  37.5 
 
 
330 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  41.16 
 
 
294 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  37.78 
 
 
313 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.88 
 
 
316 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.84 
 
 
335 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  39.81 
 
 
330 aa  188  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.1 
 
 
315 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  36.79 
 
 
306 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  37.3 
 
 
306 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  34.77 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  38.84 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  35.02 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.92 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  36.99 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  36.99 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  36.99 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  39.54 
 
 
297 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  36.99 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.34 
 
 
317 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  36.99 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  36.99 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  40.2 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  40.84 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.22 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.53 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.54 
 
 
331 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  35.83 
 
 
306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  35.83 
 
 
306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  35.83 
 
 
306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  35.83 
 
 
306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  35.83 
 
 
306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  36.68 
 
 
306 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  37.58 
 
 
314 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.44 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  34.94 
 
 
326 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  31.72 
 
 
375 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  36.81 
 
 
296 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  38.29 
 
 
313 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  38.34 
 
 
321 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.17 
 
 
291 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  34.86 
 
 
311 aa  175  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.54 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  36.79 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  36.6 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.18 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.01 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  35.65 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  33.8 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  35.56 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  36.27 
 
 
296 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.85 
 
 
314 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  34.05 
 
 
372 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.63 
 
 
283 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  38.1 
 
 
308 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.1 
 
 
334 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.54 
 
 
297 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.25 
 
 
319 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  35.95 
 
 
376 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  37.54 
 
 
314 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  35.68 
 
 
376 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 
297 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  34.86 
 
 
379 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  34.86 
 
 
377 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  34.86 
 
 
379 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  34.86 
 
 
379 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  34.86 
 
 
379 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.27 
 
 
319 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  33.78 
 
 
375 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  35.14 
 
 
377 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  32.62 
 
 
381 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>