More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0143 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  72.82 
 
 
298 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  65.99 
 
 
297 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  65.99 
 
 
297 aa  391  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  69.02 
 
 
294 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  59.06 
 
 
298 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  57.95 
 
 
302 aa  317  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  53.54 
 
 
296 aa  295  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  37.67 
 
 
381 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1422  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.69 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000419249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  41.83 
 
 
301 aa  218  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  43.88 
 
 
299 aa  219  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.57 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.07 
 
 
289 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  36.94 
 
 
386 aa  205  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  37.36 
 
 
376 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  41.69 
 
 
331 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  39.09 
 
 
311 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  39.4 
 
 
309 aa  200  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  34.62 
 
 
388 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  39.14 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  39.66 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.24 
 
 
316 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.62 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  40.52 
 
 
373 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  34.93 
 
 
375 aa  195  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  38.19 
 
 
374 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  40.13 
 
 
309 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  35.73 
 
 
369 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  37.85 
 
 
330 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.3 
 
 
325 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  39.56 
 
 
339 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.16 
 
 
324 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  35.92 
 
 
377 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  36.55 
 
 
370 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.73 
 
 
287 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  40.51 
 
 
326 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  40.19 
 
 
324 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  37.9 
 
 
374 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  39.27 
 
 
372 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  42.3 
 
 
315 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  38.04 
 
 
371 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.97 
 
 
283 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40.37 
 
 
336 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  36.88 
 
 
335 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  36.88 
 
 
335 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  37.18 
 
 
373 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.21 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.18 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  37.27 
 
 
340 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  34.97 
 
 
375 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.31 
 
 
302 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  34.58 
 
 
372 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
376 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  39.04 
 
 
287 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  37.01 
 
 
374 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
376 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  34.39 
 
 
372 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  35.39 
 
 
376 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  35.36 
 
 
376 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  38.11 
 
 
355 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  35.36 
 
 
376 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
376 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
376 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
376 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
374 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
376 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  35.92 
 
 
373 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  35.07 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  37.34 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  35.39 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  40.2 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  33.82 
 
 
373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  38.38 
 
 
380 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  32.94 
 
 
377 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  36.51 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  41.21 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  41.81 
 
 
291 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.99 
 
 
306 aa  182  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.51 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
384 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  35.98 
 
 
378 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  35.96 
 
 
370 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  36.01 
 
 
368 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  33.53 
 
 
374 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  35.67 
 
 
380 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  38.91 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  38.61 
 
 
304 aa  179  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  38.6 
 
 
330 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  42.67 
 
 
318 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  34.94 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  39.03 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.1 
 
 
341 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.1 
 
 
313 aa  178  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  37.4 
 
 
373 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>