More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0106 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
373 aa  756    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  65.41 
 
 
376 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  61.35 
 
 
374 aa  454  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  62.97 
 
 
372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  62.97 
 
 
372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  61.08 
 
 
374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  61.62 
 
 
373 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1403  chaperone protein DnaJ  63.61 
 
 
384 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00904898  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 
377 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  53.72 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  53.46 
 
 
379 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  53.46 
 
 
379 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  53.46 
 
 
379 aa  401  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  54.91 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  56.95 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  53.87 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  54.11 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  52.93 
 
 
376 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  54.67 
 
 
374 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  54.67 
 
 
374 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  52.93 
 
 
376 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
379 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 
374 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
377 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  54.52 
 
 
374 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  51.86 
 
 
375 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  54.13 
 
 
371 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  53.46 
 
 
378 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
378 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  54.13 
 
 
377 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  53.32 
 
 
389 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 
374 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
397 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
376 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
380 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  52.12 
 
 
378 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  52.79 
 
 
379 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  52.79 
 
 
379 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
382 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
382 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
376 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  51.45 
 
 
379 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  52.39 
 
 
377 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  53.46 
 
 
375 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  52.65 
 
 
382 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  53.05 
 
 
377 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  52.12 
 
 
382 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  53.03 
 
 
380 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  51.31 
 
 
378 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
378 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  53.46 
 
 
374 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
372 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
376 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  51.84 
 
 
376 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  51.57 
 
 
378 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
378 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  51.31 
 
 
378 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  51.57 
 
 
378 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  51.31 
 
 
378 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  52.52 
 
 
377 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
377 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  52.52 
 
 
378 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  49.34 
 
 
379 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  50.66 
 
 
378 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  52.66 
 
 
377 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
380 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
377 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  52.66 
 
 
376 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
379 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3963  chaperone protein DnaJ  53.74 
 
 
374 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
380 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  52.77 
 
 
380 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  50.78 
 
 
374 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  52.39 
 
 
375 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  52.66 
 
 
377 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  52.66 
 
 
377 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  51.97 
 
 
380 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  52.66 
 
 
377 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  52.66 
 
 
377 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  52.66 
 
 
377 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  52.79 
 
 
378 aa  371  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  51.19 
 
 
376 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>