More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0786 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  100 
 
 
373 aa  728    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 
380 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
383 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  51.64 
 
 
387 aa  322  7e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  48.2 
 
 
381 aa  316  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  46.04 
 
 
396 aa  309  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  43.78 
 
 
375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  46.34 
 
 
391 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  48.18 
 
 
361 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  45.17 
 
 
404 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  42.63 
 
 
377 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  43.82 
 
 
376 aa  298  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  43.28 
 
 
376 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  43.28 
 
 
376 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  45.41 
 
 
390 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  46.07 
 
 
378 aa  296  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  45.43 
 
 
374 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
387 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  42.63 
 
 
379 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  42.63 
 
 
379 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  42.63 
 
 
379 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  42.63 
 
 
379 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
400 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  42.63 
 
 
379 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  42.61 
 
 
375 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  43.71 
 
 
374 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  42.9 
 
 
386 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.85 
 
 
377 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  42.35 
 
 
382 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  43.59 
 
 
372 aa  288  1e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  44.29 
 
 
378 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  43.13 
 
 
375 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  45.04 
 
 
375 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  43.32 
 
 
374 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  44.29 
 
 
378 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  44.35 
 
 
374 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  44.17 
 
 
388 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
376 aa  285  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  43.45 
 
 
374 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.26 
 
 
379 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.26 
 
 
379 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.26 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.51 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  44.14 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  44.83 
 
 
378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  44.35 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  43.51 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  43.09 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  43.05 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  41.33 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.47 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  43.6 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  43.18 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
373 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  41.97 
 
 
375 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3920  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 
380 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
404 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  42.08 
 
 
375 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  44.08 
 
 
371 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  45.04 
 
 
394 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
380 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  43.32 
 
 
385 aa  282  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  42.39 
 
 
376 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
385 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  44.85 
 
 
379 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  43.82 
 
 
387 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  44.92 
 
 
380 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  42.39 
 
 
397 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  41.74 
 
 
381 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 
387 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  43.02 
 
 
375 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  42.7 
 
 
378 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  42.7 
 
 
378 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  43.32 
 
 
380 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  42.94 
 
 
374 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  42.7 
 
 
378 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  43.24 
 
 
366 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
393 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  42.66 
 
 
374 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
376 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  41.34 
 
 
377 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  43.73 
 
 
380 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  42.7 
 
 
378 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.3 
 
 
378 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  42.94 
 
 
374 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  45.2 
 
 
370 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
382 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  42.7 
 
 
378 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  42.47 
 
 
374 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  42.43 
 
 
378 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  43.84 
 
 
379 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
389 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>