More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0217 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  97.98 
 
 		 297 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  65.99 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  66.78 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  63.64 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  57.38 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.97 
 
 		 302 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  53.06 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1422  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.39 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000419249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  42.61 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  39.27 
 
 		 307 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  39.6 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.98 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  42.11 
 
 		 331 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.72 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  34.14 
 
 		 388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  38.96 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  41.35 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.23 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.75 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.99 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  39.42 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.17 
 
 		 325 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  34.99 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  34.38 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  39.07 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.69 
 
 		 316 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.51 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  35.61 
 
 		 378 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  37.27 
 
 		 335 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  37.27 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.94 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  36.47 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  36.47 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  34.97 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  36.47 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  35.06 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  39.8 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  34.3 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  36.99 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  36.22 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 		 374 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.14 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  35.45 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  37.07 
 
 		 372 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  35.05 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  34.39 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.39 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  35.92 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  33.43 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  37.86 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  38.85 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  34.05 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.5 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  35.49 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  34.3 
 
 		 370 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.89 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  33.24 
 
 		 378 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  39.93 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.3 
 
 		 335 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 		 387 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  41.18 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  34.47 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  35.48 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  40.65 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  35.48 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  35.89 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  34.4 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  34.25 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  35.06 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  41.02 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  34.99 
 
 		 370 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  40.68 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  35.26 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  34.66 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  34.66 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  32.96 
 
 		 375 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  34.94 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.82 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.05 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  34.94 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.29 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.18 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.18 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.18 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.18 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.19 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.18 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.18 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  36.07 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1616  chaperone protein DnaJ  32.96 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.29 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.86 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  36.83 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  34.39 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>