More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0200 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
297 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  97.98 
 
 
297 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  67.11 
 
 
298 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  65.99 
 
 
297 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  63.97 
 
 
294 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  57.72 
 
 
298 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  55.63 
 
 
302 aa  315  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  53.06 
 
 
296 aa  299  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1422  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.39 
 
 
309 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000419249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  42.27 
 
 
287 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  39.6 
 
 
307 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.32 
 
 
283 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  39.6 
 
 
301 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.05 
 
 
289 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  34.41 
 
 
388 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  41.8 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  38.96 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.09 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.23 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  41.35 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  39.31 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  38.91 
 
 
311 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.82 
 
 
339 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.17 
 
 
325 aa  195  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  39.07 
 
 
309 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  37.35 
 
 
340 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  34.88 
 
 
369 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.02 
 
 
316 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  36.84 
 
 
335 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  36.84 
 
 
335 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  35.07 
 
 
377 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  34.97 
 
 
337 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  35.64 
 
 
381 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  39.8 
 
 
299 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.24 
 
 
334 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  34.39 
 
 
373 aa  188  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  37.14 
 
 
372 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  34.1 
 
 
373 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
374 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  37.86 
 
 
309 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  35.82 
 
 
371 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  35.36 
 
 
374 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
297 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  34.4 
 
 
370 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 
324 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.39 
 
 
294 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  34.05 
 
 
379 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  38.85 
 
 
326 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  33.62 
 
 
382 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  35.8 
 
 
333 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  35.37 
 
 
299 aa  185  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.13 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  39.93 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  36.13 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  41.83 
 
 
315 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  40.65 
 
 
318 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.78 
 
 
330 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  40.65 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  38.1 
 
 
375 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  41.02 
 
 
318 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  35.63 
 
 
372 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  36.99 
 
 
335 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.95 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.83 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.27 
 
 
336 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  34.99 
 
 
370 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.62 
 
 
306 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  34.53 
 
 
380 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.5 
 
 
306 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.5 
 
 
306 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.5 
 
 
306 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.5 
 
 
306 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.5 
 
 
306 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.51 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  36.2 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.5 
 
 
306 aa  179  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  36.72 
 
 
304 aa  179  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.85 
 
 
306 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.85 
 
 
306 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.85 
 
 
306 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.85 
 
 
306 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.85 
 
 
306 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  35.51 
 
 
374 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.79 
 
 
392 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.05 
 
 
306 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  32.65 
 
 
372 aa  177  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  35.24 
 
 
381 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  38.33 
 
 
313 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  37.29 
 
 
315 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  36.49 
 
 
297 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  34.48 
 
 
374 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  37.96 
 
 
380 aa  175  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  35.08 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.82 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  40.13 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  38.19 
 
 
303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  37.81 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  36.54 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.59 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  33.99 
 
 
374 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>